我国科学家开发出转录组快速建库新方法 有望助力新型冠状病毒测序
北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显着提升。核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。目前,RNA测序技
国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列
国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。
科学家如何利用“大数据”助力人类疾病研究?
近年来,科学家们依托“大数据”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,分享给大家!图片来源:CC0 Public Domain【1】Front Immunol:大数据帮助设计更好的流感疫苗doi:10.3389/fimmu.2019.02616每年,成千上万的美国人因流感而生病,成千上万的人住院或死亡。注射
科学家发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0
非编码RNA对生物分子的调控作用,一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中,非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用,调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。10月31日,《核酸研究》(Nucleic Acids
研究开发表观组关联分析数据库
近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。近年来,表观组关联分析(Epigeno
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse populations 为题,在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所/马普计算生物学研究所徐书华团队基于20万人
研究揭示碱基编辑器的效能差异并构建可编辑致病突变数据库
近日,中国科学院上海营养与健康研究所杨力研究组与上海科技大学生命科学与技术学院陈佳研究组通过合作,系统揭示了一系列具有代表性的基因组碱基编辑器(baseeditor)的效能差异,并进一步构建了可利用20种已报道碱基编辑器进行编辑的人类疾病相关单碱基突变位点的数据库(BEable-GPS, Base Editable prediction of Global Pathogenic SNVs),相关成
我国科学家通过智能大数据平台发现鼻咽癌动态风险评估分子标志物
我国是鼻咽癌第一大国,全球近一半的鼻咽癌发生在中国。由于鼻咽癌发病部位隐蔽,70%以上患者在就诊时已经是中晚期,治疗效果较差,五年生存率不到80%。利用合适的分子标记物指导危险分层,精准提高患者疗效,一直是全世界学者研究的重点。其中,血浆EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)DNA是鼻咽坏死肿瘤细胞释放入血的一种循环DNA,可通过聚合酶链式反应(PCR)技术准确检测,
Nat Commun:大数据助力科学家阐明乳腺癌扩散的分子机制
2019年7月9日 讯 /生物谷BIOON/ --如今科学家们能够利用大量基因组数据来及早发现患者的疾病状况,但同时这也能帮助研究人员更好地研究疾病发生的分子机制。近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自密歇根州立大学的科学家们通过进行大数据分析,确定了一种更好的模型来对抗乳腺癌的扩散并能帮助测试有潜力的药物。图片来源:CC0 Public Domai
微生物科学数据共享联盟在京成立
6月18日,微生物科学数据共享联盟在京成立。联盟由中科院微生物研究所(国家微生物科学数据中心)发起倡议,旨在促进国家科学数据中心与各联盟成员单位的有效结合与深度合作,集聚各成员单位的优势资源和力量,推动我国生命科学和生物技术的快速发展。“最近几年,随着第三四代基因测序技术的推进,基因组时代来到了一个新的纪元,现在的新技术产生的数据都是以TB级(万亿字节)出现,这将带来生命科