Nat Commun:科学家成功利用大数据分析来鉴别新型的癌症风险基因
2019年1月7日 讯 /生物谷BIOON/ --诱发癌症有很多遗传原因,比如有些突变会遗传自父母,而其它则是后天获得性的突变,比如因外界因素或DNA复制的错误导致等,大规模的基因组测序在识别因体细胞突变所诱发的癌症上取得了一系列研究成果,但这种技术却无法有效识别因遗传性突变所诱发的癌症,而且识别这些遗传突变的主要来源仍然是基于家族性的研究。图片来源:iran-daily.com近日,一项刊登在国
Science:如今是时候建立一个通用的遗传数据库吗?
2018年12月2日/生物谷BIOON/---美国范德堡大学大学的一个研究团队在2018年11月23日的Science期刊上发表的一篇标题为“Is it time for a universal genetic forensic database?”的政策论坛(Policy Forum)类型文章中认为,也许是时候开始建立一个通用的遗传数据库了。他们认为这样做将有助于执法人员追查犯罪分子。图片来自C
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas、犬类数据库iDog、RNA编辑与疾病相关知识库EDK、植物RNA编辑数据库PED、人类长非编码RNA数
研究人员开发长非编码RNA数据库LncBook
近日,由中国科学院北京基因组研究所开发的人类长非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)数据库LncBook正式上线。该项研究成果以LncBook: a curated knowledgebase of human long non-coding RNAs 为题在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。近年来,有关lncRNA的
吉利德科学公布胆管炎新药最新数据
吉利德科学(Gilead Sciences)日前宣布,一项使用在研选择性非甾体法尼醇X受体(FXR)激动剂GS-9674治疗原发性硬化性胆管炎(PSC)患者的研究显示,这些患者的肝脏生化和胆汁淤积标志物得到显着改善。该数据在旧金山举行的2018年肝脏会议(The Liver Meeting?)上公布。PSC是一种罕见的慢性病,会导致肝脏排出胆汁的管道网随着时间的推移而发炎并
Nature:发现最大白血病数据库 辅助治疗药物的最优选
历经多年研究,科学家们发布了一个庞大的数据集,详细描述了500多名患有急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia,AML)患者肿瘤细胞的分子组成。该数据集包括数百个个体患者的细胞如何在实验室中对一系列药物做出反应,为日后对于AML的研究进一步打下基础。10月17日,《Nature》杂志以“Functional genomic landscape of acute
科学家用多组学数据重新划分肥胖类型,并准确预每种胖究竟更容易患哪种病
俗话说,好看的人都是相似的,不好看的人各有各的不好看。咳咳,同理,瘦的健康人大抵相同,肥胖人士则各有各的不健康,有些发生了2型糖尿病,有些患了高血压,还有一些被诊断出动脉粥样硬化和冠心病。这充分说明,肥胖人士的各种疾病风险也是有区别的,不能一概而论。能不能有一项指标,可以分辨出“肥胖的种类”,使我们准确地辨认出相关的疾病风险?诶,说来就来了。Scripps Research基因组学教授Amalio
Nature:推出小鼠细胞的开源数据库---Tabula Muris
2018年10月5日/生物谷BIOON/---来自美国斯坦福大学、陈-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub),弗吉尼亚州帕洛阿尔托医疗保健系统和加州大学的一个庞大的研究团队组建了一个名为Tabula Muris的小鼠细胞信息的开源数据库(网址:https://tabula-muris.ds.czbiohub.org/)。在他们发表在Nature期刊上的标题为“Single
两篇Nature论文聚焦英国生物样本库中的基因组和表型数据
2018年10月13日/生物谷BIOON/---两个研究团队独立地在Nature期刊上发表两篇论文,描述了使用英国生物样本库(UK Biobank)中的全套数据开展的研究。第一个研究团队由来自英国、澳大利亚和瑞士的研究人员组成---他们搜索了英国生物样本库,从中寻找遗传变异和表型之间的关联性,以便填补这些数据中的空白。第二个研究团队由牛津大学的研究人员组成---他们使用英国生物样本库旨在将遗传数据
升级版环形RNA数据库网站发布
近日,国际学术期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康院)中科院-德国马普计算生物学伙伴研究所杨力研究组关于环形RNA研究的最新进展“CIRCpedia v2: An Updated Database for Comprehensive Circular RNA Annotati