中国科学家构建首个创伤后应激障碍遗传学数据库
创伤后应激障碍(Posttraumatic stress disorder，PTSD)发生在创伤事件暴露后，是具有复杂病因的综合征。美国2013年公布的第五版《精神障碍诊断与统计手册》中，PTSD已从“焦虑障碍”组移到新的分组“创伤和应激相关障碍”中。经历创伤事件是罹患PTSD的必要条件之一，关于全球创伤事件暴露的流行病学研究表明，70%的受访者至少报告了一例创伤事件，但其中只有少数人
中国科学家发布表观基因组数据库MethBank 3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0，并将其成果以MethBank 3.0： a database of DNA methylomes across a variety of species为题，在线发表在Nucleic Acids Research上。Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。作为表观修饰的重要组成部分，DNA甲基化
科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间的作用
近日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组，中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组，与清华大学沈沁研究组合作发表的论文，以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题，在线发表
首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库发布
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population： a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human populations为题，在线发表在《核酸研究》上。该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类
英国顶级专业期刊《核酸研究》发表史上最强翻译组学数据库
11月3日，英国Oxford出版社核心生物期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》，最新影响因子10.162）发表了承启生物联合创始人张弓等共同完成的基于云计算分析平台的TranslatomeDB数据库，文章标题为“Translatome DB: a comprehensive database and cloud-based analysis platform for tr
复旦大学发表首个人类血液外泌体长链RNA数据库
最近Nucleic Acids Research杂志在线发表了首个人类血液外泌体长链RNA数据库exoRBase（www.exoRBase.org），收录了上万条环状RNA（circRNA）、长链非编码RNA（lncRNA）和mRNA。该数据库由复旦大学附属肿瘤医院/肿瘤研究所（复旦肿瘤所）黄胜林课题组完成，这是该课题组继2015年Cell Research首次报道环状RNA富集于外泌体并存在于血
中国科学家开发首个实时定量PCR内参基因知识库
近日，中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心开发了国际上首个实时定量PCR内参基因知识库——ICG。该知识库基于群体审编策略，对经生物学实验手段鉴定出的内参基因及其应用场景实现了有效的挖掘、整合及注释。研究成果以ICG：a wiki-driven knowledgebase of internal control genes for RT-qPCR normalization为题，在线发表
Cell Systems：大型基因组数据库分析或能帮助寻找和未来疾病发病风险相关的遗传突变
2017年9月14日 讯 /生物谷BIOON/ --如今，临床医生们会越来越多地使用遗传测试技术来寻找罕见疾病患者的发病原因，但寻找到病因仅仅是我们对抗疾病战斗的一部分，基因组分析的下一个前沿领域就是预测遗传突变是否是引发疾病的先兆。近日，一项刊登在国际杂志Cell Systems上的研究报告中，来自哈佛医学院的研究人员通过研究开发出了一种新方法，这种方法能够增加研究人员预测遗传突变作为疾病病因的
科学家成功利用全基因组测序数据对人群进行鉴别
2017年9月9日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究报告中，来自国外的研究人员通过研究，利用全基因组测序和机器学习等技术成功实现了对每个人面部及其它机体特征进行鉴别。图片来源：Human Longevity, Inc.研究人员认为，这项研究或为法医提供了新的方法来识别凶手，同
建立在大数据库基础上的真实世界研究---专访中山大学医药经济研究所所长 宣建伟
编者按：RWS是以患者为中心的结局研究。是运用流行病学研究方法，在真实无偏倚或偏倚较少的人群中，对某种或某些干预措施（包括诊断，治疗， 预后）的实际情况进行研究。生物谷： 宣教授您好，非常感谢您参加生物谷主办的2017真实世界研究峰会， 并在会前接受生物谷的采访。真实世界研究提出之后，中国真实世界医疗大数据库的建立水到渠成，请您介绍一下真实世界医疗大数据库建立的背景和意义以及医疗大数据分析在循证医