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Small:提出构建超高通量悬浮芯片的新策略

  近日,上海交通大学生物医学工程学院古宏晨-徐宏研究团队在新型超高通量悬浮芯片的设计构建及用于单反应多指标生物检测技术方面取得突破性进展,研究成果“Precisely Encoded Barcodes through the Structure-Fluorescence Combinational Strategy: A Flexibl

2021-05-26

Genome Biology:开发出单细胞基因组单分子测序新方法

单细胞全基因组测序技术(scWGS)可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性,并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化,例如拷贝数变异(CNV)和点突变(单核苷酸变异,SNV)等。过去十年,研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术,例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术(MDA)、多重退火和基于环的扩增循环技术(MALB

2021-07-07

Nature Communications:RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础

  RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结

2021-06-28

6小时建成,最高6万日检测通量!华大智造为深圳盐田“火眼”实验室提供核心工具保障

近来,广东地区疫情牵动着全国人民的心。5月30日晚,深圳市政府新闻办举行疫情防控新闻发布会,强调重点场所人员全覆盖核酸检测,并实施港口疫情防控全流程闭环管理等措施。6月2日0-24时,深圳无新增确诊病例和无症状感染者。截至6月2日24时,深圳市累计报告新冠肺炎确诊病例506例。为积极响应疫区全民核酸检测的通量需求,加快当地大规模核酸检测效率,总部位于深圳盐田

2021-06-04

红豆杉染色体水平基因组测序完成

  紫杉醇是目前已发现的最优秀的天然抗癌药物。紫杉醇生物合成途径已研究多年,而超大的基因组和复杂的代谢路线是途径解析的主要限制因素。中国科学院天津工业生物技术研究所与西北工业大学、深圳华大生命科学研究院等合作,首次完成了喜马拉雅红豆杉超10Gb的染色体水平的全基因组测序,并通过复杂基因组组装与分析,解析了红豆杉中生物合成紫杉醇的关键基因簇

2021-06-01

Cell Rep:基于类器官的高通量RNA测序有助于寻找治疗结直肠癌的药物

大肠癌(CRC)是当今世界上确诊率最高的3种癌症之一,也是与癌症相关的发病率和死亡率的主要原因之一。尽管近年来癌症疗法在不断地发展,但针对晚期和转移性肠癌患者仍然缺乏有效的治疗方法,因此迫切需要基于药物的新型疗法。

2021-04-25

Frontiers in Plant Science:大豆突变体基因定位测序方法改良研究获进展

随着新一代测序技术的发展和全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)成本的不断下降,基于WGS的分离群体分组分析(Bulk Segregation Analysis,BSA)已成为快速定位候选基因的常规工具,但已报道的方法仍有待完善。例如,依赖于自交系杂交的QTL-seq策略需要后期耗费大量精力进行精细定位;而基于突变体的Mut

2021-06-07

从实验室到临床:2021版《结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识》发布,助力结直肠癌精准治疗

 近日,《临床肿瘤学杂志》发布了2021版《结直肠癌分子检测高通量测序中国专家共识》(以下简称“共识”), 该《共识》由中国抗癌协会靶向治疗专业委员会发起,在临床、病理等多个领域20余名专家指导下,以及行业内10余家头部诊断企业的参与支持下,结合结直肠癌实际诊疗需求,分别从结直肠癌NGS检测的临床角度和实验室流程质控角度出发提供指导意见,历经一年反

2021-04-22

鹦鹉螺基因组测序分析揭示针孔眼形成和生物矿化机制

  近日,中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室喻子牛团队首次在国际上完成了鹦鹉螺全基因组测序,揭示了这种古老软体动物的进化规律、针孔眼形成和生物矿化机制。相关研究成果以论文“The genome of Nautilus pompilius illuminates eye evolution and biomineral

2021-05-11

利用全基因组测序揭示CRISPR / Cas9在葡萄上的脱靶效应

  近日,Horticulture Research在线发表了西北农林科技大学葡萄种质资源与育种团队王西平课题组题为“Whole genome sequencing reveals rare off-target mutations in CRISPR/Cas9-edited grapevine”的研究论文。青年教师王现行与涂明星博士为该

2021-05-10