Gastroenterology:研究通过单细胞基因组测序揭示肝细胞癌的双相拷贝数演化模型
胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中,研究人
赋能科研 | 华大智造DNBSEQ测序平台为ChinaMAP中国人群参考基因集及研究提供核心工具
基因型推断(Genotype imputation)是对基因分型芯片或基因组测序数据的缺失基因型进行填补的基本方法,在全基因组关联等研究中可显著提高遗传关联变异位点的精确定位。
研究人员提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术
中山大学生命科学学院骆观正教授团队提出一种用于鉴定微量样品m6A的高效便捷建库测序技术,鉴定到数千个高重复性m6A位点,为促进m6A功能研究提供方法学创新。N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A) 是真核生物mRNA中含量最丰富的碱基修饰类型,动态调控mRNA的剪接、定位、降解等多种代谢通路,进而参与细胞分化、肿瘤发生、免疫反应等重
Communications Biology:研究人员开发出基于液滴微流控的链霉菌高通量筛选技术平台
链霉菌是重要的工业微生物,可以生产蛋白、小分子药物等高附加值产品。工业生产中,常用随机诱变手段产生大量的链霉菌突变库,但缺乏与之相适配的高通量筛选手段用以获得目标突变株。已报道的基于流式细胞分选的方法只能对链霉菌的原生质体或孢子进行筛选,由于抗生素等次级代谢产物多产生于菌丝发酵的平台期,因而原生质体或孢子均无法代表链霉菌的真实发酵状态
低通量筛选发现抗疟候选药物
这一期的《科学转化医学》杂志发表一项赛诺菲与几所大学科学家合作发现抗疟候选新药的工作。与主流的高通量筛选上百万化合物不同,作者从赛诺菲进入临床的化合物中挑选350个化合物、加上450个对疟原虫各种蛋白的其它物种同源蛋白有一定活性的化合物作为筛选库。用一个细胞测试筛选这800个化合物得到6个系列120个活性好于1uM的苗头化合物、命中率15%,这远高于~0.5
Science子刊:新型高通量无细胞无病毒定量中和测试方法可检测患者对SARS-CoV-2的免疫力,灵敏度高达96.7%
2021年7月17日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自瑞士洛桑大学医院和洛桑联邦理工学院的研究人员开发出一种新的高通量无细胞无病毒定量中和测试方法(high-throughput cell- and virus-free quantitative neutralization assay),其灵敏度足以测量血液中存在的SARS-CoV-2中和
CRISPR-Cas9高通量功能基因筛选技术有助对肝癌的理解
上海交通大学医学院附属仁济医院上海市肿瘤研究所覃文新团队在《自然综述·胃肠病学和肝病学》杂志(Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology)发表长篇述评,全面总结了CRISPR-Cas9功能基因筛选技术在肝癌中的研究进展,阐述了当前利用该技术在探索肝癌发生发展和耐药机制以及开发治疗新靶点新策略等方面的进展,
华大智造DNBSEQ-E5基因测序仪最快4.5小时完成病原微生物测序
7月15-16日,第二届感染性疾病诊断技术创新论坛(IDD)刚在武汉顺利闭幕,华大智造携病原微生物高通量测序平台亮相。在论坛上,华大智造官方首次发布了DNBSEQ-E5基因测序仪在科研和实战场景下的一系列使用数据。据悉,DNBSEQ-E5基因测序仪体积小、重量轻、测序速度快、操作简单,大大降低了基因测序仪的使用门槛。即日起,该设备在中国大陆开放订购。“我们希
用生命“赌”病因,全基因组测序是否能终结求医苦旅?
世界上有近7000种罕见病,约80%罕见病是源于基因缺陷导致的遗传病。但由于人类基因组含有约30亿对碱基对,造成由基因缺陷导致的罕见病不仅种类繁多,还很少见,大部分医生们很难有相关诊断经验,导致罕见病人的诊断之路充满迷雾般的坎坷。有数据显示,全球每个罕见病患者平均看过8个医生、有过3次误诊经历、平均确诊时间长达7年多。
Small:提出构建超高通量悬浮芯片的新策略
近日,上海交通大学生物医学工程学院古宏晨-徐宏研究团队在新型超高通量悬浮芯片的设计构建及用于单反应多指标生物检测技术方面取得突破性进展,研究成果“Precisely Encoded Barcodes through the Structure-Fluorescence Combinational Strategy: A Flexibl