Sci Rep：计算机成像技术揭示肿瘤内血流信号
2019年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --约翰·霍普金斯大学医学研究人员表示，他们开发了一种类似于“谷歌地图”的方法，可以更准确地计算和可视化肿瘤生长所需的结构和功能性血管变化。通过将来自动物模型的肿瘤标本的高质量3D成像数据与复杂的数学公式配对，研究人员表示，他们现在拥有一个能够准确表示肿瘤内血液流量的模型，包括复杂的血流量，氧合作用和发生的结构变化。这项工作于3月27日在Nature
基于人工智能和计算机辅助药物设计的研究方法方面获进展
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队，利用人工智能和计算生物学的方法从158万个化合物中寻找到了17个嗅觉受体蛋白Olf73的活性药物分子。该工作为基于嗅觉受体蛋白的药物发现与设计提供了有力的理论基础和依据。该成果以Computational modeling of the olfactory receptor Olfr73 suggests a mo
多项研究表明一种让G蛋白偶联受体热稳定的计算方法在解析这类受体结构中大有可为
2019年4月16日讯/生物谷BIOON/---来自俄罗斯莫斯科物理科学与技术研究所（MIPT）、斯科尔科沃科学技术研究所（Skoltech）和美国南加州大学（USC）的研究人员开发出一种新的计算方法来设计热稳定的G蛋白偶联受体（GPCR），这对开发新药有很大帮助。经证实这种方法可用于获得几种主要人类受体的结构。对这种新方法的概述发表在2019年4月的Current Opinion on Stru
JCIM：人类激酶计算机模型有望帮助开发新型癌症疗法
2019年4月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究报告中，来自加州理工州立大学的科学家们通过研究开发了一种人类MEK1蛋白计算机模型，MEK1是科学家们有望开发多种人类癌症疗法的潜在药物靶点。图片来源：theconversation.com当参与细胞增殖的分子信号错误时，癌细胞就
Nat Chem：超级计算机帮助“组装”大型蛋白质复合体
2019年4月1日 讯 /生物谷BIOON/ --红细胞中的血红蛋白分子通过以全有或全无的方式改变其形状来传输氧气。血红蛋白中相同蛋白质的四个拷贝像花瓣一样打开和关闭，在结构上相互耦合以相互作用。使用超级计算机，科学家们能够设计自组装的蛋白质，以组合和类似生命的分子，如血红蛋白。科学家表示，他们的方法可以应用于有用的技术，如药物靶向，人工能量收集，“智能”传感和建筑材料等。一个科学团队通过增加蛋白
财政部：罕见病药品依照3%征收率计算缴纳增值税
2月22日消息，财政部发布关于罕见病药品增值税政策的通知，自2019年3月1日起，增值税一般纳税人生产销售和批发、零售罕见病药品，可选择按照简易办法依照3%征收率计算缴纳增值税。上述纳税人选择简易办法计算缴纳增值税后，36个月内不得变更。自2019年3月1日起，对进口罕见病药品，减按3%征收进口环节增值税。以下为通知全文：关于罕见病药品增值税政策的通知财税〔2019〕24号各省、自治区、直辖市、计
羧酸还原酶催化机制的计算解析领域取得进展
羧酸还原酶（Carboxylic acid reductase， CAR）是一类多功能酶，广泛分布于细菌、真菌及部分植物体内，依赖辅因子ATP和NADPH，可高效催化由羧酸到醛的化学反应，不仅反应条件温和、底物谱宽泛、针对性强、可专一识别羧酸基团，还能解决化学合成法产生的环保压力和能源问题，显着降低生产过程中的资源与能源消耗。此外，CAR还可与醇脱氢酶、转氨酶和亚胺还原酶等形成级联反应，生成醇类、
研究开发新的表观遗传通路统计算法
11月30日，国际学术期刊Nature Methods 发表了中国科学院上海营养与健康研究院计算生物学研究所Andrew Teschendorff组的研究论文“Identification of differentially methylated cell types in epigenome-wide association studies”，报道了一种新的有助于识别与疾病相关的表观遗传通路的“
QB期刊 |RNA-seq数据计算方法大汇总
引言 分子生物学的中心法则自1958年由Francis Crick提出到今年正好60周年，它描述了“DNA制造RNA，RNA制造蛋白质”的遗传信息的标准流程 [1]。十年前，第二代RNA测序技术(RNA-seq)的诞生及其迅速发展使得研究者可以在对RNA序列没有任何先验信息的情况下高通量地对全转录组进行测序 [2]。现如今第二
Management Science：新计算方法可提高肾移植成功率
2018年9月6日 讯 /生物谷BIOON/ --终末肾功能衰竭的患者需要经常透析或新捐献的肾脏才能存活。供体肾脏的来源可以是尸体或找到自愿以及兼容的活体捐赠者（通常是家庭成员）。然后，进行医学和心理学测试以确定该供体是否确实是相容的。如果测试确定，例如，供体的肾脏不太可能被患者的身体接受，则该过程停止并重新开始寻找新的供体。（图片来源：www.pixabay.com）最近的一项创新是出现了一种称