科研人员开发基于分子网络特征整合单细胞数据的新方法
随着单细胞测序技术的快速发展,多个全球性的、大规模的细胞图谱项目相继启动,例如人类细胞图谱计划等。然而,把来自于不同组织、不同发育阶段或者只有很少重叠细胞类型的单细胞转录组数据集进行准确有效的整合仍然具有非常大的挑战性。因为当前整合单细胞数据的方法需要校正批次效应从而达到整合分析的目的,而上述所涉及的数据集的批次信息不清晰,利用这些方
CRISPR/Cas9组合筛选揭示了人类乳腺癌中相互作用的肿瘤抑制基因和治疗靶点的上位性网络
大多数癌症是由多种基因改变驱动的,但这些改变在肿瘤发生过程中是如何协同作用的仍然是未知数。
关于面部表情加工的大脑网络研究获进展
面部表情加工是人类解读他人情绪状态、参与社交活动等必备的重要能力。这一加工过程依赖于视觉皮层、特异性脸部识别脑区、情绪感知脑区等神经基础。现有的表情加工模型揭示了腹侧通路(枕叶面孔区、梭状回面孔区、额下回/额中回)与背侧通路(中颞视区和颞上沟)在表情加工或有不同分工,但存在争论,有待深入研究明晰其作用。中国科学院心理研究所脑与认知科学国家重点实验室研究员傅小
Science:头颈鳞状细胞癌的蛋白网络图谱可揭示PIK3CA突变体的药物敏感性
为了描述HNSCC的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)景观,来自美国加州大学圣地亚哥分校和加州大学旧金山分校的研究人员根据对HNSCC肿瘤进行的癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)分析所确定的分子通路改变来选择蛋白。另外的蛋白是根据存在复发性点突变的基因或以前发表的与HNSCC有关的基因添加的。
研究揭示MAPK信号途径调控小菜蛾对Bt Cry1Ac杀虫蛋白抗药性信号网络的拓扑结构和功能机制
近日,蔬菜花卉研究所蔬菜害虫防控团队绘制了Bt Cry1Ac杀虫蛋白的高抗小菜蛾中MAPK信号途径反式调控多个中肠受体基因和非受体同源基因差异表达的信号网络。该研究首次揭示了MAPK信号途径参与害虫抗药性的分子调控网络,研究结果对于指导重大农业害虫对Bt抗性的监测预警以及转Bt基因抗虫作物的抗性治理具有重要的理论和实践意义。相关内容以
研究揭示麦类特异转座子重塑小麦环境适应的调控网络
转座子(Transposable Element,TE)是基因组中可移动的DNA元件。小麦族物种的转座子呈现爆发性增长,基因组高达3-16 Gb,85%以上由TE组成,而与之亲缘关系密切的二穗短柄草基因组只有272 Mb。可以说小麦的基因是“散落”在TE的海洋中,那么这些TE群体仅仅是自我复制垃圾序列,还是会影响宿主的基因活性与适应性呢?中国科学
研究利用动态网络生物标记分析发现甘薯膨大的分子机制
中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员张鹏研究组与中科院分子细胞科学卓越创新中心研究员陈洛南研究组合作,在The Plant Journal上发表了题为Dynamic network biomarker analysis discovers IbNAC083 in initiation and regulation of sweet
Journal of Psychiatric Research:发现大脑腹侧苍白球与默认网络间的功能连接和创伤后快感缺失症状相关
快感缺失是指个体在通常会引起积极情绪的情况下,唤起积极情绪能力的缺陷。快感缺失症状存在于多种精神障碍中,也是个体经历创伤事件后常见的一种不良反应。中国科学院心理健康重点实验室王力研究组的前期研究发现,快感缺失是创伤后应激障碍中的一个独立存在的症状维度,表征了创伤应激对正性效价系统功能的影响。快感缺失被证实在创伤后的心理病理过程中发挥了重要作用,理
NeuroImage:发现反刍思维状态下默认网络动态稳定性下降而额顶控制网络稳定性上升
反刍思维是指对发生在自己身上的负性生活事件本身及其可能的原因和后果的反复思考。反刍思维具有显着的现象学特征,个体的思维内容常在进入反刍思维状态以后变得单调、循环往复,仅仅关注自我和过去,这种现象学特征可能和脑活动的动态稳定性特点相关。动态稳定性是指大脑不同脑区之间的交互随着心理活动的变化,在进行动态变化的同时仍然能够维持总体上稳定的特
Trends in Immunology:淋巴器官成纤维细胞网状细胞和管道网络作用
不同免疫细胞群的相互协调作用可促进识别病原体或癌细胞,并能精确协调免疫激活和免疫调节之间的平衡。这种平衡的建立和维持依赖于身体内外表面信息的有效和准确传输以及不同免疫细胞群之间的信息交流。