多篇文章解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新进展!
革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展
2024-04-30
Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。
2024-05-27
Cell Genomics:刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录组跨模态整合分析的AI框架——UniTCR
UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架,以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。
2024-05-06
干细胞、类器官与表观遗传学的交响曲!Nat Neurosci:科学家构建单细胞表观基因组图谱,揭示调控细胞命运的关键“开关”
本研究中构建的人类神经类器官发育的单细胞表观基因组图谱,为深入了解人类细胞命运选择提供了宝贵的参考蓝本。
2024-07-22
Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录组学变化及FOXP1的调控作用
该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。
2024-04-11
Signal Transduct Target Ther | 苏州大学胡士军/沈振亚等合作:中国空间站上的第一项宇宙生物学研究
研究团队指出,hiPSC衍生的心肌细胞(hiPSC-CMs)可以模拟微重力对人类心脏的影响,并在国际空间站上的太空飞行期间发现了细胞水平上的钙处理和基因表达的变化。
2024-04-19
空间几何约束诱导细菌与宿主细胞粘附的力学生物学机制研究方面取得新进展
该研究不仅阐明了空间几何约束微环境调控细菌-细胞界面粘附的力学生物学机制,也为抗生素辅剂的筛选和临床上改善细菌抗生素治疗方案提供了可借鉴的思路和策略。
2024-02-15
Nature Genetics | 癌症基因组学的新突破:探索复杂基因型与表型关联的组合遗传策略
该研究中研究人员通过将编码癌症相关基因事件的条形码慢病毒文库高效地随机引入到原代上皮细胞中,并将这些细胞移植到小鼠中以选择肿瘤原克隆。
2024-03-06
《自然·微生物学》:科学家发现,移植健康的粪便病毒组,可以改善慢性压力下的免疫和大脑基因变化
这项研究表明,微生物组-肠-脑轴对压力的一系列反应由肠道病毒组介导,并且可以通过移植未经受压力的粪便病毒组逆转。
2024-02-26