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Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录中的RNA结构开关

该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。

2024-07-20

Cell Metabolism | 营养素影响胰岛素分泌的蛋白质密码

这项研究在人胰岛中确定了碳水化合物、蛋白质和脂质三种营养素的胰岛素分泌反应,搭建了在线数据平台:www.humanlislands.com作为胰岛深层表型网络资源。

2024-08-12

李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录的影响

本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术,探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。

2024-04-12

Nature子刊:研究发展出复杂体系中可同时鉴定配体靶蛋白质和结合位点的蛋白质方法

研究利用蛋白质在结合配体后局部稳定性的变化,开发了在复杂体系中可以同时高灵敏鉴定配体结合蛋白和结合位点的蛋白质组学新方法(PELSA)。

2024-12-27

单细胞和空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Journal of Advanced Research: 转录关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路

研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。

2024-07-30

Nature Genetics | BANKSY:革命性算法,重塑空间数据分析

随着生物技术的快速发展,空间组学数据的产出呈现爆炸式增长,传统的数据分析方法已难以满足研究的需求。BANKSY算法的开发旨在解决这一问题。

2024-03-05

Cell:刘真/木良善/李辰/孙怡迪/朱文成团队利用比较蛋白阐明人类早期胚胎发育的成功与失败

该研究在技术改进、资源挖掘、发现探索和临床应用等方面进行了整合,为理解人类和小鼠的着床前胚胎发育,以及人类着床前发育失败提供了新的视角、资源和思路。

2025-01-26

【报名倒计时】2024空间多维创新转化研讨会,4月12日上海开幕!

“2024空间多维组学创新转化研讨会”,将于4月12日在上海召开!诚邀国内多位科学家、临床专家和行业专家分享各自领域的空间多组学应用及研究进展,探讨与推动医学领域的创新转化。

2024-04-01