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Nat Commun:高通量筛选揭示肠炎患者体内大肠杆菌感染的内在机制

粘附侵袭性大肠杆菌(AIEC)是克罗恩氏病患者(一种常见的肠道炎症)体内常见的致病菌。尽管这类病原菌与共生性的大肠杆菌具有很多表型方面的差异,通过基因组学的手段往往难以区分这两种不同的亚群,因而导致难以鉴定出关键的致病因子。在最近发表在《Nature Communications》杂志上的一篇研究中,来自加拿大McMaster大学的Brian K. Coom

2021-04-04

Cell Rep: 抗病毒药物筛选揭示DNA损伤修复抑制剂的抵抗SARS-CoV-2感染的能力

SARS-CoV-2传播引发的COVID-19疫情已经成为全球性的公共健康危机,因此,寻找能够抑制病毒感染能力的药物也成为了亟待解决的问题。在最近发表在《Cell Reports》杂志上的研究中,来自美国加州洛杉矶分校的Vaithilingaraja Arumugaswami团队通过高通量的药物筛选系统,从430中蛋白质激酶抑制剂中筛选得到了34个候选物,这

2021-04-07

Nature子刊:揭示一种化学物混合物可产生大量的肌肉干细胞

2021年3月23日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员鉴定出一种化学物混合物,它能够大量地产生可以自我更新并可产生所有类型骨骼肌细胞的肌肉干细胞。这一进展可能导致开发基于干细胞的疗法,以治疗因受伤、年龄或疾病而导致的肌肉损失或损伤。相关研究结果近期发表在Nature Biomedical Engineering

2021-03-23

eLife:新型全基因组CRISPR筛选技术或能发现与癌症发生相关的关键通路

2021年3月17日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志eLife上的研究报告中,来自范德堡大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型全基因组CRISPR筛选技术,其或能帮助揭示80%-90%的肿瘤是如何生长的。这种新方法能够检测一种特殊的遗传开关,而该开关能诱导持续性的细胞分裂(癌症开始的标志物)。CRISPR是规律成簇的间隔短回文重复

2021-03-17

不同款新冠疫苗混合接种可行吗?

世界多国正面临新冠疫苗供应不足的压力,尤其是低收入国家“一剂难求”的问题广受关注。全球范围已获批的新冠疫苗一般需接种两剂。如果不同款疫苗在两次接种中可以混用,疫苗供应的灵活性将大幅提升。该策略是否可行?英国已启动相关试验寻求答案。英国牛津大学近日发表公报说,该校研究人员领导的一项临床试验,将探索首剂和第二剂“加强针”接种使用不同新冠疫苗的可行性。这项试验从英

2021-02-15

基于人工智能成功筛选出生物钟相关功能基因

  苏州大学剑桥-苏大基因组资源中心的研究团队利用开发的基于机器学习(卷积神经网络)识别同步化参数的人工智能算法,设计了能系统化和自动化识别小鼠活动及饮食昼夜节律的筛选器。他们与来自国际上14个科研机构的团队合作,针对国际小鼠表型分析联盟的野生型小鼠数据开展了生物钟相关功能基因高通量筛选研究。研究团队通过对750个突变小鼠品系的活动和饮食

2021-02-04

Science子刊:我国科学家基于全基因组筛选鉴定出促进细胞衰老的基因KAT7

2021年1月8日讯/生物谷BIOON/---理解细胞衰老的遗传学和表观遗传学基础对于开发减缓衰老的干预措施至关重要。虽然已知细胞衰老会促进老化,但控制这一过程的许多机制仍然知之甚少。在一项新的研究中,来自中国科学院、中国科学院大学、北京大学和首都医科大学宣武医院的研究人员使用两种类型的表现出加速衰老的人间充质前体细胞(hMPC)进行了基于CRISPR-Ca

2021-01-08

纳米孔测序准确鉴定混合谱系(MLL)白血病复杂易位,识别差异性甲基化规律

 急性白血病是一种骨髓癌症,特征是骨髓中由超过20%的白血病母细胞,治疗目标是达到完全缓解,有功能正常的骨髓,母细胞少于5%,而每位患者对治疗都会有不同的响应,并有可能存在具有临床显着性的微小残留病变(MRD),我们需要了解这些微小残留病变,因为它可能会导致复发,MRD监测是急性白血病和其它癌症中的一个快速新兴的领域。Tracy专注于混合谱系白血病

2020-11-19

利用新开发的CRISPR-LICHT技术筛选出决定人类大脑大小的基因

2020年11月12日讯/生物谷BIOON/---生物学中的许多基本原理和基本上所有调节发育的途径都是在所谓的遗传筛选中发现的。遗传筛选最初是在果蝇和秀丽隐杆线虫中开创的,它涉及到许多基因的逐一失活。通过分析基因失活的后果,科学家们可以得出关于其功能的结论。比如,这种方式可以确定大脑形成所需的所有基因。在果蝇和线虫身上可以常规地进行遗传筛选。在人类中,存在着丰

2020-11-12

梁晗课题组报道大规模肿瘤药物蛋白扰动效应筛选数据集

 对由进化所规定的种群、个体及细胞层级的基因型(genotype)与表现型(phenotype)之间的关联的解析是分子生物学研究的核心课题。就方法论而言,基因扰动实验(perturbation)和基因型——表现型特征统计分析是两条具有统治地位的路径,它们能够分别揭示出具有因果关系的(causal)或者具有相关性的(correlative)调控者——

2020-11-08