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清华大学张强锋团队开发单细胞测序数据在线整合算法SCALEX

SCALEX有一个特殊的优势,就是它的高泛化性的编码器。这个编码器可以通过单细胞测序数据投射,生成一个批次无关的统一低维细胞嵌入空间。

2022-10-21

科研人员发布人类基因组结构变异数据库和计算分析平台

复旦大学生命科学学院/人类表型组研究院教授徐书华团队、中国科学院上海营养与健康研究所研究员张国庆、复旦大学生命科学学院研究员樊少华合作,开发出人类基因组结构变异数据库PGG.SV.

2022-10-21

不止低钠,2.5万人数据分析显示,多补钾也能够有效降低心血管疾病风险,女性从中受获益更大

这项研究强调,保护心血管、降低CVD风险,不单只有降低钠摄入量这一条路可走,提高钾摄入量也不失为一个好方法,并且暗示补钾除了能够减轻身体中高钠负担

2022-08-04

Science:在迄今最大规模的全基因组测序数据中鉴定替换突变特征

突变特征(mutational signature,也译为突变信号、突变标记或突变签名)---在肿瘤发生过程中起作用的DNA损伤和修复过程的印记---使人们了解每名患者所患癌症的环境原因和内源性原因。

2022-04-23

近300万肠镜检查数据分析:结直肠癌筛查起始年龄应提前到45岁

  结直肠癌(大肠癌,CRC)是对初始在结肠或直肠部位的组织发展形成的癌症统称。根据世界卫生组织国际癌症研究署(IARC)发布的最新数据显示,结直肠癌是仅次于乳腺癌和肺癌的第三大常见癌症,患者占比高达9.4%,其中中国结直肠癌患者占全球31%。结直肠癌曾一直被认为是一种老年疾病,即发病风险随年龄的增长而增加。然而,约10%的新发病例年龄在

2022-01-14

ICG-16 | 华大智造测序仪全平台性能新升级,数据产出更高、更稳定,质量更优!

第十六届国际基因组学大会(ICG-16)于10月25-31日在山东青岛隆重举办。

2021-11-02

科研人员研发出磁共振脑影像一键式数据处理与分析软件平台

 功能磁共振成像(Functional magnetic resonance imaging,fMRI)技术被广泛应用于有关认知、情绪、发展和脑功能障碍的脑科学研究中。然而,传统的基于三维体空间的磁共振分析方法可能导致部分容积效应,即一个三维的脑区可能同时包含来自灰质、白质,甚至脑脊液的信号。研究发现人类脑功能是以大脑皮层表面的形式组织起来的,因此

2021-10-22

中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法,并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组

   三代测序技术(PacBio和Oxford Nanopore)可解决基因组重复区域的组装难题,提高基因组完整性,已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中,纳米孔(Nanopore)测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低,并且由于其可实现超长读长(高达1Mbp),在复杂基因组组装中具有天然优势。然

2021-01-15

通过功能性的数据分析揭示基因组中LINE-1转座子元件的特性和动态变化!

2020年10月13日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一篇发表在国际杂志Molecular Biology and Evolution上题为“Human L1 Transposition Dynamics Unraveled with Functional Data Analysis”的研究报告中,来自宾夕法尼亚州立大学等机构的科学家们通过研究深入揭示

2020-10-12

GigaScience:在全球首次开发基于人工智能技术的VariantSpark平台 能对一万亿个基因组数据进行分析并找出多种致病基因

2020年10月12日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,一篇发表在国际杂志GigaScience上的研究报告中,来自澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)等机构的科学家们在世界上首次通过利用基于人工智能技术的VariantSpark平台来处理一万亿个基因组数据,该平台还能帮助锁定人类基因组中特定疾病致病基因的具体位点。图片来源:CC0 Public

2020-10-12