单细胞测序找到背后原因
黑色素瘤是最为致命的皮肤癌类型，且发病率不低——根据美国癌症学会的统计，每38名白种人里，就有1人会在生命中的某一时刻罹患黑色素瘤。如果发现得早，这种恶性肿瘤还可以通过手术切除。一旦它发生扩散，治疗手段就会大受局限。但要早期发现黑色素瘤并非易事。在很多人的意识里，黑色素瘤来源于痣的恶化。然而事实上，这只能解释部分黑色素瘤的起源。大部分黑色素瘤在发
Genome Med：单细胞RNA测序技术或能揭示胰腺肿瘤中单个细胞的特性 有望帮助开发个体化胰腺癌疗法
2020年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一篇发表在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中，来自美国翻译基因组学研究院等机构的科学家们通过研究详细描述了组成胰腺癌微环境的单个细胞的特性，这或许有望帮助开发新型疗法来治疗这种侵袭性且难以治疗的癌症类型。图片来源：CC0 Public Domain文章中，研究人员利用一种名为单细胞
Nat Immunol：转录因子BATF3改善CD8+ T细胞存活和免疫记忆
2020年10月6日讯/生物谷BIOON/---当人体受到病原体感染后，它通常会启动一连串的反应，其中免疫系统中称为T细胞的特定细胞会在淋巴结中被激活，随后发生分裂和增殖。与此同时，这些细胞将获得某些使得它们能够摧毁其他细胞（比如被病毒感染的细胞）的功能。此外，它们还能产生某些蛋白，即所谓的细胞因子，从而阻止病原体的繁殖。德国维尔茨堡大学系统免疫学研究所的W
Science特刊从转录组角度专注于人体遗传变异
2020年9月21日讯/生物谷BIOON/---人类表型的全貌源自常见和罕见的遗传变异的混合，其中的一些遗传变异会影响基因在体内的表达和剪接方式。十多年前，科学家们为了更好地了解遗传多样性对健康人体的影响，发起了基因型-组织表达（Genotype-Tissue Expression, GTEx）联盟。在此，Science期刊公布了这个项目的第三阶段也是最后一
科学家们成功在单细胞分辨率下解析机体肠道神经系统的奥秘！
2020年9月29日 讯 /生物谷BIOON/ --整个胃肠道系统中嵌入的是一种更为广泛的神经元阵列，其会协调几乎所有的活动，包括消化、肠道运动以及对有害刺激的反应等，这些细胞就组成了肠道神经系统（ENS，enteric nervous system），并能将信号传输到大脑中，但其非常稀少且很脆弱，很难进行分离和深入研究，近日，一项刊登在国际杂志Cell上题
研究揭示miR-133a的转录调控机制及其在细胞分化中的作用
9月9日，国际学术期刊Cell Death & Disease发表了中国科学院生物物理研究所卫涛涛课题组与美国Creighton大学屠亚平课题组的合作论文，这是卫涛涛课题组与屠亚平课题组长期合作所取得的又一成果。研究人员发现，miR-133a表达的上调促进了线粒体生物发生和肌细胞分化，并进一步通过“定向染色质构象捕获”（CAPTURE）技术找到了调控
《细胞》亮点：庄小威联合团队看清染色质转录动态；单细胞测序揭示肺癌难根治原因
顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术，能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出，染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构，无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此，研究人员
科学家开发出高通量检测单细胞mRNA动态变化的新技术scNT-seq
细胞命运转变以及响应外界信号的过程中会改变细胞类型特异（cell-type-specific）的基因表达，而基因表达的丰度(total RNA level)是由mRNA转录、加工、降解等过程共同决定的。在含有多种细胞类型的复杂组织和系统中，在单细胞水平准确测定这些 mRNA动态变化过程对于理解基因表达调控的重要性不言而喻。传统的mRNA代谢标记技
Cell Rep：单细胞测序预测化疗的有效性
在最近一项研究中，来自密歇根大学的Jun Hee Lee博士课题组使用一种单细胞RNA测序的技术，首次展示了单个癌细胞群中的各个细胞对化学疗法引起的DNA损伤的基因表达差异。他们发现，这些反应可以被分为三类：激控制细胞死亡，细胞分裂或应激反应。相关结果发表在最近的《Cell Reports》杂志上。
研究发现细胞命运调控的“表观组-代谢组-表观组”跨界蝴蝶效应
8月24日，《自然-代谢》（Nature Metabolism）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院刘兴国课题组的研究成果。该研究提出由母系转录因子Glis1调控多能干细胞命运的“表观组-代谢组-表观组”的跨界级联反应新概念，表明Glis1实现衰老细胞重编程并稳定基因组的功能，揭示Glis1介导“表观组-代谢组-表观组”的级联反应中，糖酵解代谢组驱动