利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性
2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的，但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成，而转录组指的是在某一特定条件下，细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中，细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化，因此染色质可接近性有
Science：构建出真涡虫细胞类型转录组图谱
2018年4月24日/生物谷BIOON/---真涡虫是一类相对简单的动物，具有不同寻常的生物学特征：成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞（progenitor cell）。真涡虫获得人们的大量研究，部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whitehead Institute。在一项新的研究中，来自美国怀特
Cell:基于高通量单细胞转录组测序小鼠全细胞图谱发表
在国家自然科学基金项目（项目编号：31722027）等资助下，浙江大学医学院干细胞与再生医学中心郭国骥教授团队在单细胞组学技术及哺乳动物全细胞表达谱系分析研究中取得突破性进展。相关成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”（利用微孔板测序技术绘制小鼠细胞图谱）为题，于2018年2月23日在生命科学国际顶尖期刊Cell（《细胞》）
单个细胞转录组测序成本降至1美分！《科学》期刊发布重磅SPLit-seq技术
许多疾病，例如阿尔兹海默病和帕金森病，都源于某些类型细胞的功能障碍。对这些类型的细胞进行深度分析、发掘致病基因，将有助于了解疾病的病因和进展情况，进而帮助开发出相应的治疗方法。通过单细胞RNA测序技术对细胞进行分类是现阶段重要的研究方向，但是现有方法价格昂贵，且需要专门的设备，严重阻碍了单细胞研究的广泛开展。近日，一项最新研究成果为单细胞测序技术带来了突破，有望将单个细胞的测序成本降至
Cell：开发出空间单细胞测序技术，有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜
2018年1月12日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传模型可能解释着一种常见的被称作导管原位癌（ductal carcinoma in situ, DCIS）的早期乳腺癌如何进展到更为浸润性的乳腺癌。相关研究结果于2018年1月4日在线发表在Cell期刊上，论文标题为“Multiclonal Invasion in Breast
科学家揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间的作用
近日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组，中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组，与清华大学沈沁研究组合作发表的论文，以Inference of differentiation time for single cell transcriptomes using cell population reference data为题，在线发表
利用单细胞转录组分析揭示成纤维细胞转化为心肌细胞机制
图片来自Qian Lab, UNC School of Medicine。2017年10月28日/生物谷BIOON/---在心脏病发作后，通过逆转瘢痕组织产生健康的心肌组织将会引发心脏学和再生医学领域的变革。在实验室中，科学家们已证实将心脏成纤维细胞（瘢痕组织细胞）转化为心肌细胞是可行的，但是梳理出这是如何发生的细节并不是件容易的事情，而且将这种方法用于临床实践或甚至其他的基础研究项目中一直都是难
在单细胞转录组分辨率下重建虚拟果蝇胚胎
图片来自Drosophila Virtual Expression eXplorer/BIMSB at the MDC。2017年9月10日/生物谷BIOON/---在经过13次快速的细胞分裂之后，一个受精的果蝇卵子产生大约6000个细胞。它们在显微镜下看起来都一样。然而，在那时，果蝇胚胎中的每个细胞已知道它是变成神经元还是肌肉细胞，或2017年9月10日/生物谷BIOON/---者变成肠道、头部
谈一谈单细胞代谢组学
代谢组学是20世纪90年代中期发展起来的一门新兴学科，研究对象大都是相对分子质量在1000以内的小分子物质。这门继基因组学、转录组学和蛋白质组学之后出现的学科经过二十多年的发展目前已经在疾病早期诊断、药物靶点发现、疾病机理研究及疾病诊断等方面取得了许多重大进展。生物学研究的历程往往要经过从宏观表型的观察到微观机制的探索，最后再回到宏观表型的解释和修正这样一个过程。在代谢组学出现之前，就有科学家已经
利用单细胞甲基化组鉴定出新的神经元亚型
图片来自Salk Institute/Jamie Simon。2017年8月13日/生物谷BIOON/---在显微镜下，人们很难区分任何两个神经元之间的区别。神经元是储存和处理信息的脑细胞。因此，科学家们利用分子方法，试图鉴定出具有不同功能的神经元群体。如今，在一项新的研究中，来自美国沙克生物研究所和加州大学圣地亚哥分校的研究人员首次分析了单个神经元中的DNA分子发生的化学修饰，从而提供迄今为止最