单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
一天两篇Cell:西湖大学闫浈团队揭示叶绿体蛋白转运动力机制与进化多样性
为了解答这一难题,科学家们尝试了包括免疫共沉淀、交联质谱、遗传敲除等策略,但至今未能完全揭示马达的真面目。要确定谁是马达的金标准,便是找到能与转运系统TOC-TIC直接相互作用,共同协作的蛋白。
2024-09-03
科研人员开发估算祖先细胞群体大小的算法TarCA用于揭示早期细胞命运决定
该研究开发的TarCA算法可对任意细胞群体估计祖先细胞数目,而无需事先获得祖细胞的先验信息,也能推算少数细胞中的驱动基因,以此来预测早期细胞命运的分化倾向。
2024-03-18
Nature Medicine | 革新心血管疾病预测:QR4算法提升心血管病风险评估准确性
心血管疾病是全球范围内最主要的死亡原因。这些疾病主要包括冠状动脉疾病(coronary artery disease)、心肌梗死(myocardial infarction)和脑卒中(stroke)。
2024-04-24
Acta Pharmaceutica Sinica B:藏红花基因组揭示了藏红花素生物合成的进化起源
本研究报道了鸢尾科药用植物C. sativus首个染色体水平基因组,为鸢尾科药用植物的基因组进化和物种形成提供了重要的见解。
2024-04-09
Nature methods | 从序列到结构:探索CombFold组装算法的三重奏
CombFold能够有效地预测出大型蛋白质复合体的三维结构,即使是对于那些由多个不同亚基构成、结构复杂度高的复合体也同样适用。
2024-02-13
PNAS:清华大学程功团队发现一种进化保守机制促进蚊媒病毒感染与传播
LS-102小分子是HRD1的特异性抑制剂,也是用作治疗类风湿性关节炎等疾病的候选药物小分子。研究团队发现LS-102能显著抑制登革病毒感染埃及伊蚊及AG6小鼠模型。
2024-04-12
来自5万年前尼安德特人的守护:清华大学刘万里团队等揭示IgG1进化及其在抵御病原体中的作用
研究团队的一系列交叉学科的研究结果,揭示了宿主遗传变异作为疾病表型的影响因素的重要性,特别是在新发SARS-CoV-2传染病和其他人类历史上的感染事件中的潜在作用。
2024-09-13
Nature Chemical Biology:类胡萝卜素裂解酶趋同进化生成视觉发色团
近段时间,来自美国加利福尼亚州尔湾市加州大学尔湾医学院生理学与生物物理学系的Yasmeen J. Solano教授及团队报告了卷心菜环虱的高分辨率晶体结构。
2024-02-29