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Science:利用FLSHclust新算法发现188种新的CRISPR/Cas系统

微生物序列数据库包含大量有关酶和其他可用于生物技术的分子的信息。但近年来,这些数据库已经变得非常庞大,以至于很难有效地搜索到感兴趣的酶。

2023-11-30

应晓敏/伯晓晨团队开发基于生成式人工智能的新算法MIDAS,实现单细胞多组学数据的马赛克整合

研究提出了一种用于单细胞多组学数据马赛克整合及知识迁移的计算工具——MIDAS,首次实现了通用的单细胞多组学马赛克数据的模态对齐、数据补全、批次校正等整合功能。

2024-01-25

TRIP12在健康和疾病中是TGFβ信号的进化保守调节剂

TGFβ家族是一组参与多种细胞过程的多功能细胞因子,包括胚胎发生、免疫细胞功能、细胞周期调节、组织稳态、细胞外基质生成以及组织重塑和修复。

2023-12-25

破解HIV潜入人类细胞核之谜,华人学者Nature论文发现,HIV病毒衣壳进化成了一种核转运蛋白,逃过细胞防御系统

核孔复合物(NPC)由约30种不同的核孔蛋白(Nup)构建而成,其中包括约10种所谓的FG-Nup,它们将形成屏障的苯丙氨酸-甘氨酸(FG)重复结构域锚定到NPC支架上,呈凝胶状。

2024-02-04

研究揭示益母草碱合成途径及进化机制

该研究利用多组学和多系统生化实验,从头构建了益母草碱的生物合成途径,揭示了益母草碱在植物体中的合成之谜。这一成果为益母草碱的绿色、高效生物合成奠定了基础,有望在未来推动益母草和益母草碱的开发和利用。

2023-11-15

Nature重磅:斯坦福大学开发AI算法,衡量人体各个器官衰老,进而预测疾病和死亡

简而言之,根据这项研究,在50岁以上的、表面看起来健康的成年人中,大约五分之一的人至少有一个器官相比于同龄人更快老化。

2023-12-07

为何同性恋没有在进化中消失?张建之/宋斯亮团队揭示双性恋基因有助于繁衍后代

这项发表在 Science Advances 的最新研究表明,男性双性恋者可能具有繁殖优势,并拥有更多的后代,由此解释了与同性性行为相关的等位基因为什么可以在人类的物种进化过程中持续遗传。

2024-01-05

Genome Medicine:浙江大学良渚实验室沈宁团队发布实现单细胞水平肿瘤细胞群突变与表达异质性的同步研究算法

该研究为癌症领域单细胞水平基因型与表型关联的异质性与进化研究提供方便有效的工具,为临床诊断提供新的方向。

2023-12-27

Nature子刊:王永明团队进化出适用性更广的紧凑型Cas9

该研究应用噬菌体辅助进化,开发出一种紧凑型Cas9核酸酶——SlugCas9-NNG,其能够识别简单的NNG PAM序列,进一步扩大了基因编辑靶向范围。

2023-12-07

Science:快速的细菌-噬菌体共同进化促进高度复杂的生态网络的出现

按照查尔斯-达尔文在 19 世纪的构想,进化是一个缓慢而渐进的过程,在这一过程中,物种的适应能力是代代相传的。然而,如今生物学家可以看到进化变化是如何在更快的时间尺度上展开的。

2023-11-24