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Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。

2024-11-23

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

Nat Biotechnol:科学家通过利用新型算法分析肿瘤的遗传组成 有望准确测定癌症的进化机制

文章中,研究人员详细了一种新型在线资源,其或能帮助科学家们选择最佳的算法进行肿瘤进化的分析,同时还能增强对肿瘤的诊断准确性和疗法计划。

2024-06-21

研究揭示尿路上皮癌进化的核心基因密码

上述研究为开发针对ecDNA的精准治疗策略奠定了基础。

2025-03-26

Nature Biotechnology:线粒体基因编辑迎来“超进化”——新型TALEDs效率飙升

这项研究不仅首次阐明了TALEDs依赖于细胞自身的“修复机制”——碱基切除修复 (base excision repair, BER) 通路,还创新性地开发出了性能更强大的升级版TALEDs 。

2025-03-31

深度学习算法揭示m6A在RNA异构体上的复杂性

该研究为理解m6A在异构体上的复杂性以及m6A的选择性调控机理提供了新的视角。

2025-03-04

豆科植物根瘤共生固氮进化机制研究获进展

研究发现,豆科植物对根瘤菌共生固氮的适应性进化需要植物保守基因、豆科获得基因、豆科丢失基因,而建立豆科植物根瘤菌共生固氮是上述基因共同作用的结果。

2024-10-13

研究人员设计出基于图表示学习和蛋白质语言模型的深度生成算法

该研究成果推进了深度生成模型用于功能蛋白质设计,为进一步剖析蛋白质设计规律并开展生物实验验证奠定了基础

2024-12-29

Nature:揭秘SARS-CoV-2在大流行中不断进化背后的分子机制

这篇研究报告中,研究人员通过联合研究对150多万名个体进行了人口层面上的流行病学分析,共涵盖了从疾病大流行开始的四年时间。

2025-02-16