Nature：利用人工智能系统Alphafold发布最完整的预测人类蛋白质三维结构数据库
2021年7月24日讯/生物谷BIOON/---2021年7月22日，DeepMind宣布与欧洲分子生物学实验室（EMBL）合作，为人类蛋白质组的预测蛋白质结构模型建立迄今为止最完整、最精确的数据库。这将涵盖人类基因组所表达的全部约20000种蛋白质，并且这些数据将免费向科学界公开提供。该数据库和人工智能系统为结构生物学家提供了探究蛋白质三维结构的强大的新工
25亿美元跨洋医疗收购案的选择——当纳利金融（DFIN）Venue®虚拟数据库
随全球疫情控制形势变化，医疗领域的并购交易亦呈回暖态势。当纳利金融服务集团（NYSE: DFIN）业内当先的资本市场解决方案，臂助全球各个领域的交易项目顺利达成。2018年，生物科技公司Synthorx借助由DFIN研发的Venue®虚拟数据库成功上市（IPO融资达1.51亿美元）；一年后，在应对包括法国制药巨头赛诺菲（Sanofi）在
三个实例：“基于动力学的数据科学”在生命科学中的应用
21世纪以来，生物大数据在量（多数据种类，海量样本数，多时间点采样等）、质（高时空精度，单细胞测序等）两方面快速发展，大大推动了生命科学的进步，也为生物医学问题的模型建立、数据分析，以及预测和控制，带来了巨大的机遇和挑战。传统的生物学数据研究方法大多基于数据的静态统计信息，即“基于统计学的数据科学”(statistics-based
Genome Biology：科学家揭晓通路信息大数据的秘密
每年有成千上万的通路图(pathway diagrams)被发表出来，而这些通路图由于是静态图形导致无法进行计算查询和分析。
中国学者公布莲基因组数据库
近日，武汉市园林科学研究院和中科院武汉植物园携手研发出破译荷花遗传密码的莲基因组数据库。日前，该数据库在国际知名学术期刊公布，供各国荷花研究人员免费共享。据介绍，水生植物莲是地球上最早出现的开花植物之一。研究发现，早在约1.4亿年前蕨类植物和恐龙称霸地球的时代，在北半球许多水域已有莲的分布。武汉市园林科学研究院具有悠久的荷花研究传统与历史，目前收
研究公布水生植物莲的基因组遗传变异与表达数据库
莲为水生植物，俗称荷花（莲科莲属），莲的起源较早，对研究被子植物（有花植物）的起源与演化具有重要的指导意义。在实际生产中，莲花色、花型丰富多样，且赋予了特殊的文化内涵，在园林景观中应用广泛；兼具食用、药用等重要价值，引发学界关注。基于此，中国科学院武汉植物园水生植物生物地理学学科组与武汉市园林科学研究院科研人员合作，构建了莲的基因组遗
研究发布新的非编码RNA整合资源NONCODEV6数据库
长非编码RNA（long non-coding RNAs）是一类长度大于200 nt的非编码RNA。已有研究表明，长非编码RNA具有重要的调控功能，在植物和动物的生物学过程中发挥重要作用。此外，lncRNA还与人类一些疾病的发生发展密切相关。因此，对lncRNA的注释、探索lncRNA的功能具有重要意义。近年来，一些研究集中于lncRNA功能的探
研究人员建立衰老生物学多组学数据库
随着人口老龄化程度加剧，实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来，随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展，衰老相关多组学数据层出叠见。然而，目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组，与北京基因组研究所（国家生物信息中心）鲍一明研究组、张维绮研究组合作建立了A
国家微生物科学数据中心牵头制定的国际ISO微生物数据标准正式发布
微生物资源是国家的重要战略资源，微生物数据资源则是微生物资源共享和开发的关键环节，数据资源的丰富性、准确性和共享水平，决定着微生物学领域研究和应用的综合能力。2020年11月9日，国际标准化组织生物技术委员会（ISO/TC 276）正式发布微生物资源中心数据管理和数据发布标准（ISO 21710）。这是国际微生物领域的第一个ISO级别的数据标准，
研究人员发表基于离子淌度质谱的多维代谢物鉴定技术和数据库
中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱正江课题组发展了基于离子淌度质谱的碰撞截面积数据库（AllCCS），并开发出基于离子淌度质谱的多维代谢物分析技术，用于生命体内已知和未知代谢物的化学结构鉴定。离子淌度质谱（Ion Mobility-Mass Spectrometry）是一类能够根据分析物离子的尺寸、形状和电荷进行气相分离和检测的质谱技