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研究揭示转座子在近着丝粒异染色质区调控机制

异染色质是指基因组中用DAPI染色较深、相对不开放的区域。这类区域被认为是基因组中的“黑洞”。以往研究认为,异染色质的基因组通常处于沉默状态。随着转录组学测序技术的发展,研究发现异染色质并非一直保持沉默。基因组学研究发现,细胞间期异染色质的稳定可以保证基因组结构的稳定。分裂期的异染色质,尤其是位于着丝粒区域以及近着丝粒区域的异染色质,其稳定性可帮助遗传信息在

2020-11-21

研究发现电离辐射引起核内染色质结构调控证据

 染色质是真核生命遗传物质DNA在细胞核内的存在形式,染色质根据细胞的活动状态和响应过程,如DNA复制、基因转录、DNA损伤响应和修复等,进行结构调节。染色质结构受电离辐射发生双链断裂(DSB)后的解聚现象已有报道,但是学界缺乏关于核内原位的染色质结构改变的证据支持,DNA发生双链断裂后,损伤响应和修复蛋白形成的修复聚合体亚结构图像亦不清楚。近日,

2020-11-05

研究观测染色质重塑中DNA的B-Z构象转变

 近年来,Z型DNA(Z-DNA)的研究引发关注,但是在细胞中对其进行观测还存在困难,主要原因是缺少一种简便可靠的手段对其进行直接观测。最近,中国科学院合肥物质科学研究院智能机械研究所研究员黄青课题组与郑州大学张凤秋课题组合作,利用红外光谱技术观测并研究染色质重塑中DNA的B-Z构象转变,相关研究成果发表在Analytical Chemistry上

2020-11-01

研究揭示开放核小体导致染色质松散的分子机制

 常规核小体的结构包括一个由四种组蛋白H2A、H2B、H3、H4组装而成的蛋白核心,一条在组蛋白核心上缠绕1.6圈、长度为147 bp的双链DNA。核小体具有稳定的结构,对DNA组成和组蛋白修饰的改变均不敏感。组蛋白变体可改变核小体和染色质结构调控基因转录,在迄今测定的所有单核小体结构中,组蛋白H3变体核小体是构象改变最大的CENP-A核小体,结构

2020-10-23

揭示染色质抑制cGAS从而阻止自身免疫反应机制

2020年9月16日讯/生物谷BIOON/---在高等生物中,检测到细胞质中的DNA会引发免疫反应。感知“错位”DNA的酶也存在于细胞核中,但细胞核DNA没有这样的效果。如今,在一项新的研究中,来自德国慕尼黑大学的研究人员报告了为何会这样。相关研究结果于2020年9月10日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Structural basis for s

2020-09-16

地钱中TCP家族转录因子活性与染色质三维构象变化相关

  基因组学的研究不应止步于从基因组序列或表观遗传修饰中获得信息,深入挖掘三维染色质折叠对于了解基因组功能同样至关重要。近十年来,高通量测序技术的进步和高分辨率成像技术的发展使得基因组复杂的三维结构组织形式日益清晰的呈现在人们眼前。其中,利用Hi-C(high-throughput chromosome conformation capt

2020-09-11

《细胞》亮点:庄小威联合团队看清染色质转录动态;单细胞测序揭示肺癌难根治原因

 顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术,能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出,染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构,无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此,研究人员

2020-08-22

研究揭示染色质重塑因子Smarca5促进胚胎期造血干祖细胞发育

 造血作用可以产生所有类型的血细胞,包括红细胞、血小板、巨噬细胞和淋巴细胞等。这些血细胞来源于具有自我更新和多向分化潜能的造血干祖细胞(hematopoietic stem and progenitor cells,HSPCs)。脊椎动物中,最早的新生造血干祖细胞,是由主动脉-性腺-中肾区(aorta-gonad-mesonephros,AGM)的

2020-08-11

研究发现节律调控染色质重塑和脂代谢基因表达的分子开关

5月4日,国际学术期刊Nature Metabolism 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所丁秋蓉课题组的研究论文“MRG15 orchestrates rhythmic epigenomic remodeling and controls hepatic lipid metabolism”。该研究发现MRG15作为一个进化上保守的表观调控因子在调控肝

2020-05-08

Oncotarget:研究揭示染色质暴露程度对于人类癌症的发生与发展的影响

在最近一项研究中,作者分析了404位癌症患者的ATAC-seq数据,并将染色质的分子特性与患者的人口统计学,肿瘤组织学,分子亚型和生存率之间建立了联系。

2020-05-07