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Science:利用单细胞染色质图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序

多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。

2024-09-27

当小鼠胚胎长出额外的双腿:揭秘胚胎发育中的染色质变化

该研究通过探索Tgfbr1在调控小鼠后肢和外生殖器之间的发育可塑性中的作用,对遗传学、发育生物学和进化论做出了重要贡献。

2024-04-05

冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录染色质动态图谱获得进展

中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组利用RNA-seq、ATAC-seq和CUT&Tag技术,绘制了田间冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱。

2024-07-13

Mol Cell | HDACs调控异染色质沉默和表观遗传的分子机制

研究结果表明,表达靶向异染色质的Snf5会阻碍异染色质的表观遗传信息传播,而这是通过抑制Clr4的读写机制影响了H3K9me3修饰的延伸。

2024-08-22

Nat Methods:scNanoSeq-CUT&Tag技术:精准检测单细胞基因组复杂区域的染色质修饰

该研究开发了一种基于单分子测序平台的 scNanoSeq-CUT&Tag 新方法,可以精准检测单个细胞内染色质修饰特征,包括组蛋白修饰和转录因子的结合分布模式。

2024-10-12

Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质图谱

SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。

2024-07-16

Cell Metabolism | 先锋因子AP-1介导衰老和成熟相关染色质重塑

这篇文章利用ATAC-seq和RNA-seq关联分析揭示了与衰老和成熟过程中的染色质重塑和TFs重分布特征,发现了先锋因子AP-1在其中的关键作用。

2024-08-04

Nature Methods | 革新癌症治疗:EpiChem技术揭示药物与染色质结合的单细胞层面机制

EpiChem为在单细胞水平上解析小分子药物与基因组相互作用及其表观基因组状态提供了一种独特的方法。这一技术的潜在应用范围广泛,从药物开发到理解细胞异质性,都具有重要意义。

2024-07-24

Nature:我国科学家揭示脊椎动物旁着丝粒异染色质起始的保守机制

这项新的研究揭示了组成性旁着丝粒异染色质的从头建立机制,并解释了为什么脊椎动物中明显非保守的旁着丝粒异染色质序列仍然具有相同的组蛋白H3K9me3修饰。

2024-07-15

骨髓基质细胞诱导多发性骨髓瘤细胞染色质重塑导致转录变化

该研究揭示了骨髓基质细胞诱导多发性骨髓瘤细胞染色质重塑导致转录变化。

2024-05-31