昆明植物所利用第二代高通量测序仪首次解析麻竹花转录组
中国科学院昆明植物研究所郭振华研究组和李德铢研究组多年来致力于竹子的繁殖和开花机理研究。最近,利用高通量的Illumina GAII测序平台,研究人员对木本竹种麻竹(Dendrocalamus latiflorus)不同发育时期的花组织进行了转录组测序。测序共产生了约96,000,000个reads,经de novo从头组装后共得到了146,395个高质量的unigene,平均长度为461 bp。
:基于染色质免疫沉淀和高通量测序的鉴定DNA易损位点的手段
2012年12月17日,北京生命科学研究所杜立林实验室在《Genome Research》杂志在线发表题为“Mapping genomic hotspots of DNA damage by a single-strand-DNA-compatible and strand-specific ChIP-seq method”的文章。
GLOBAL CHANGE BIOL:森林土壤主要温室气体通量调控机制研究获新进展
目前已有的研究结果显示出调控森林土壤主要温室气体(CO2,CH4, N2O)通量的因素很多,如外部环境因子(温度、降水、氮沉降等),土壤特性(物理、化学、生物等)等,但如何量化这些因素的调控作用并没有得到很好的解决,成为这些气体通量模型发展的瓶颈。
:microRNA表达谱的高通量非标记检测技术
microRNA是近年来发现的一种单链的短链RNA,长度约22个碱基,在动植物及人类中广泛存在,与发育、分化、凋亡、脂肪代谢、病毒感染和癌症等多种重要生物学过程有密切的联系,并显示出作为癌症、心血管等重大疾病等方面的新的分子标记物的巨大潜力,是近十年来的一个研究的热点。对microRNA表达谱进行高通量、低成本的检测对于该领域的发展具有重要的意义。
Diabetes care:遗传易感性改变ATP合酶通量的个体反应
12月21日,在线发表在Diabetes care杂志上的一项随机、平行组设计研究"A Single Nucleotide Polymorphism Associates With the Response of Muscle ATP Synthesis to Long-Term Exercise Training in Relatives of Type 2 Diabetic Humans"显示
Lab on a Chip:甘明哲等开发出高通量微生物培养芯片
近日,来自中科院苏州纳米技术与纳米仿生研究所国际实验室的研究人员设计并开发出了高通量微生物培养芯片,该芯片目前设计已申请专利,相关研究结果已在国际杂志Small和Lab on a Chip上发表。 微生物已经在工业、农业、能源、环境、医药等诸多领域发挥着无可替代的作用。筛选获得优良的菌种是提升相关产业技术水平的重要途径。通常,微生物的液体培养筛选需要同时在数十上百个培养瓶或试管中进行。