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揭示IscB-ωRNA在RNA引导下切割DNA机制

CRISPR-Cas9系统利用向导RNA(gRNA)识别靶DNA序列。当发现匹配的DNA序列时,Cas9蛋白会在正确的位置切割靶DNA,然后就有可能在DNA水平上进行外科手术来修复遗传疾病。

2022-05-30

Nat Commun:新模型首次揭示了CRISPR-Cas9的DNA切割行为

在一项新的研究中,来自荷兰代尔夫特理工大学的研究人员提出了一种基于物理的模型,它建立了一个关于CRISPR-Cas9基因编辑如何运作的定量框架,并允许他们预测在哪里、以何种概率以及为何会发生靶向错误,即脱靶。这项研究使我们首次对当今最重要的基因编辑平台背后的机制有了详细的物理了解。

2022-03-30

Science:开发空间切割和标记新技术绘制组织发育机制图

瑞典卡罗斯卡医学院和耶鲁大学合作开发了一项新技术,可提供特定组织中活跃和失活基因的精确位置信息,为不同组织如何发育,以及表观遗传调控如何促进疾病发展提供重要知识。研究成果在《科学》杂志上发表。不同功能的细胞都包含相同的基因组,差异在于哪些基因被激活,这是由表观遗传学调控的。在胚胎发育过程中,不同的表观遗传修饰会打开和关闭某些基因,从而形成不同的器官。虽然目前

2022-03-19

揭示脱氧核酶切割RNA分子机制

在一项新的研究中,来自德国杜塞尔多夫大学、波恩大学和尤利希研究中心的研究人员在原子分辨率下研究了DNAzyme如何实时地发挥作用。相关研究结果发表在2022年1月6日的Nature期刊上,论文标题为“Time-resolved structural analysis of an RNA-cleaving DNA catalyst”。

2022-01-09

Carbohydrate Polymers:发表水蛭透明质酸酶结构与切割模式研究成果

江南大学生物工程学院康振教授团队在水蛭透明质酸酶结构与切割模式机制解析方面取得重要进展,研究成果“Structure and cleavage pattern of a hyaluronate 3-glycanohydrolase in the glycoside hydrolase 79 family”正式发表于Carbohydrate Polymers

2022-01-06

Nature:系统性揭示抗生素对肠道细菌的附带损害,及其潜在对策

在一项新的研究中,德国海德堡欧洲分子生物学实验室(EMBL)的Athanasios Typas团队和图宾根大学的Lisa Maier团队及其合作者们分析了144种抗生素对我们最常见肠道微生物的影响。这项研究极大地提高了我们对抗生素对肠道微生物影响的理解。它还提出了一种新的方法来减轻抗生素治疗对肠道微生物组的不利影响。

2021-10-15

发现一种精确切割RNA的CRISPR系统---Cas7-11

研究人员发现了一种细菌酶,他们说这种酶可以扩大科学家们使用的CRISPR工具箱,使其能够轻松地切割和编辑RNA。这种他们最终命名为Cas7-11的细菌酶在不伤害细胞的情况下修改RNA靶标。

2021-09-09

发现一种新型的切割RNA的III型CRISPR-Cas系统

荷兰代尔夫特理工大学的Stan Brouns博士及其研究团队发现了一种新型的可以切割RNA的III型CRISPR-Cas系统。这一发现预计将为基因研究和生物技术的新应用开发提供许多机会。

2021-08-28

Nature Communications:RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础

  RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结

2021-06-28

Mol Cell:细胞凋亡阶段Caspase切割核蛋白XRCC4调节细胞膜磷脂结构的改变

细胞濒临死亡时,其细胞膜中的磷脂分子结构会发生紊乱,进而促进磷脂酰丝氨酸的暴露,这是胞吐作用的关键过程。此前研究发现Xkr家族蛋白Xkr4对于磷脂分子结构的紊乱具有关键的作用,但其激活机制仍然未知。在最近一项研究中,来自日本京都大学的Jun Suzuki教授等人揭示了Xkr4被激活的两个步骤:caspase介导的切割形成的二聚体,以及激活因子引起的结构变化。

2021-04-03