BBRC:章张团队研究开发出DNA序列并行比对新工具
最近,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。
Nat Methods:蛋白序列比对新工具HHblits更快更准
近日,来自德国慕尼黑大学的研究人员在Nature Methods杂志上发表论文"HHblits: lightning-fast iterative protein sequence searching by HMM-HMM alignment"介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits,这是一种能极大增加蛋白功能性分析技术的软件,能通过新颖的序列寻找方法...
Methods:德发明蛋白序列比对新工具——HHblits
近日,德国慕尼黑大学的研究人员发表论文介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits。相关成果公布在《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上。
国际花生基因组计划首次完成并公布两个二倍体野生种全基因组序列
2014年4月2日,由多国农作物遗传学家参与的国际花生基因组计划(International Peanut Genome Initiative,IPGI)终获喜报。
Cell Reports:复合物Msh2-Msh3干扰冈崎片段加工来促进三核苷酸重复序列扩增
2012年9月3日 讯 /生物谷BIOON/ --科学家们假设DNA复制错误会导致三核苷酸重复(trinucleotide repeat, TNR)序列扩增,特别是在DNA滞后链的复制过程中。如果滞后链能够成功复制的话,那么就需要对冈崎片段进行加工,并将它们连接到连续链(continuous strand)上。
Gene Dev:揭示基因序列长度在基因表达中发挥着关键性作用
2012年10月9日 讯 /生物谷BIOON/ --来自丹麦奥胡斯大学的研究人员揭示人基因末端之间存在令人吃惊的相互作用:如果一种蛋白编码基因太短的话,它将失活。这些发现也解释了一些短序列的基因如何进化来克服这种难题。相关研究结果于2012年发表在Genes & Development期刊上。 人基因组容纳着上千个基因,每个基因当它是活性时能够产生蛋白。
Nat Genet:完成对毛竹基因组序列的框架图
2月24日,国际著名杂志Nature Genetics杂志在线发表了由中国林业科学研究院林业研究所、中国科学院上海生科院植生生态所国家基因研究中心和国际竹藤中心等合作完成的“毛竹全基因序列框架图”的论文。
Evol Bioinfor:于军等重复序列与哺乳动物基因组内含子扩张关系研究获进展
近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Evolutionary Bioinformatics杂志发表。
世界首个蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成
12月18日,内蒙古自治区呼和浩特市召开的“世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成成果发布会”,我国科学家绘制完成了全世界首个蒙古族人全基因组序列图谱。 据项目总负责人、内蒙古农业大学生命科学学院动物生物技术重点实验室主任周欢敏介绍,这一研究成果是我国科学家首次独立完成的、具有自主知识产权的蒙古族人全基因组序列图谱,标志着我国的人类学、民族学、人类遗传学及医学健康研究进入了基因组水平。
Delphi Genetics试剂盒中所有菌株已全部进行了全序列测定
12月19日,在第34届日本分子生物学会年会上,Delphi Genetics宣布,该公司所销售的研究试剂盒中的所有菌株已确立了完整的染色体序列。Delphi Genetics研究试剂盒中的大肠杆菌菌株均已进行了全序列测定,成为全球第一个菌株基因序列明确的研究工具。 这些用于研究的完全基因测序的大肠杆菌(E. coli)菌株在全球是第一个,它将确保研究人员常规工作使用的材料是基因序列完全明确的。