科学家呼吁出台标准保证生命科学研究可重复性
Nat Methods:蛋白序列比对新工具HHblits更快更准
近日,来自德国慕尼黑大学的研究人员在Nature Methods杂志上发表论文"HHblits: lightning-fast iterative protein sequence searching by HMM-HMM alignment"介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits,这是一种能极大增加蛋白功能性分析技术的软件,能通过新颖的序列寻找方法...
Methods:德发明蛋白序列比对新工具——HHblits
近日,德国慕尼黑大学的研究人员发表论文介绍一种能提高蛋白序列比对分析的新工具:HHblits。相关成果公布在《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上。
世界首个蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成
12月18日,内蒙古自治区呼和浩特市召开的“世界首例蒙古族人全基因组序列图谱绘制完成成果发布会”,我国科学家绘制完成了全世界首个蒙古族人全基因组序列图谱。 据项目总负责人、内蒙古农业大学生命科学学院动物生物技术重点实验室主任周欢敏介绍,这一研究成果是我国科学家首次独立完成的、具有自主知识产权的蒙古族人全基因组序列图谱,标志着我国的人类学、民族学、人类遗传学及医学健康研究进入了基因组水平。
Delphi Genetics试剂盒中所有菌株已全部进行了全序列测定
12月19日,在第34届日本分子生物学会年会上,Delphi Genetics宣布,该公司所销售的研究试剂盒中的所有菌株已确立了完整的染色体序列。Delphi Genetics研究试剂盒中的大肠杆菌菌株均已进行了全序列测定,成为全球第一个菌株基因序列明确的研究工具。 这些用于研究的完全基因测序的大肠杆菌(E. coli)菌株在全球是第一个,它将确保研究人员常规工作使用的材料是基因序列完全明确的。
游隼和猎隼全基因组序列图谱绘制完成
2011年12月16日,在阿拉伯联合酋长国艾恩市举行的第二届国际猎鹰节上,来自英国、中国和阿拉伯的研究人员联合宣布游隼和猎隼的全基因组序列图谱绘制完成。该研究成果对游隼和猎隼的起源、进化及其它生物学特性研究具有重要的科学价值,对挽救和保护游隼和猎隼具有十分重要的意义。
绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱完成
据国家烟草专卖局官方网站报道,绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱已经由中国烟草完成。这是全球第一套烟草全基因组序列图谱,也是继马铃薯和番茄基因组之后全球完成的第三种茄科植物全基因组序列图谱。该绒毛状烟草和林烟草全基因组序列图谱是目前已知植物基因组序列图谱中基因组最大、组装精度最高、组装结果最好的2个图谱。
Science:不活跃基因在人体DNA序列中普遍存在
近日,英国和美国的研究人员发现健康个体存在许多这样的变异,因基因功能缺失而导致囊肿性纤维症和肌肉萎缩症等疾病。论文的作者表示,这项研究有助于研究人员区分常见无害的遗传变异和罕见危险的遗传变异,从而更好地查明突变导致的疾病。相关论文发表在近期的Science杂志上。
Nat Rev Gene:占用与序列的复杂性
近日,刊登在国际著名评论杂志Nature Reviews Genetics上的研究指出,基因组非编码区域的变化越来越多地被涉及到复杂性状间的个体差异,包括疾病易感性,然而阐释非编码变化的功能效应却是一项特殊的挑战。最近发表的两篇论文系统地研究了SNP对于转录因子结合的影响,从而表明尽管序列与结合之间的一些趋势正如预期的那样,但预测特定SNP的效应将是很困难的。