Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nature Methods：形态学数据与人工智能的交响曲——“细胞绘图”的无限可能
“细胞绘图”技术的未来充满希望。随着批次效应校正、数据整合和实时成像等领域的持续突破，这一技术将进一步推动生命科学的前沿研究，成为从基础生物学到临床医学的关键工具，为健康和科学探索开辟更多可能性。
2024-12-10
大脑中的“园丁”与“杂草”Nature：利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明，细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性，在塑造衰老过程中起着关键作用。
2024-12-27
Mol Cell：HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域，从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制，最终激活多个癌症驱动基因，驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Ann Rheum Dis：肠道微生物组变化与临床明显的类风湿关节炎发病有关
类风湿性关节炎高危人群的肠道微生物组成与众不同，包括但不限于过量的普雷沃氏菌（Prevotellaceae）。这种微生物特征是一致的，并与传统的风险因素相关。
2024-11-30
北京大学最新Cell论文：白洋团队构建全球首个作物根际“细菌+病毒”基因组数据库
该研究结合多种作物的根际可培养细菌基因组与宏基因组数据，构建了作物根际细菌基因组数据库（CRBC）和作物根际病毒基因组数据库（CRVC），显著扩展了公开可用的作物根际细菌基因组数量约 3 倍，鉴定的病
2025-03-15
Nat Cell Biol：赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念，依托人工智能纳米孔自适应测序算法，能够实时判断测序分子来源，并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
Science：用AI模拟5亿年的进化，创造出全新荧光蛋白，重新点亮生物学
这项新研究所展示的 ESM3 模型，训练自地球上多达数十亿的天然蛋白质，ESM3 也是当今世界上训练于最高通量 GPU 集群之一的前沿生物学生成式人工智能模型。
2025-02-27
Cell Stem Cell：隋鹏飞课题组揭示肺基底干细胞线粒体代谢调控新机制
本研究揭示了线粒体丙酮酸代谢在肺基底干细胞命运决定中的核心作用，构建了代谢与表观遗传的调控环路。这一发现为肺部疾病的治疗提供了新的思路。
2024-11-01