Science子刊：我国科学家开发出针对ctDNA甲基化特征的机器学习算法来诊断结直肠癌
在一项新的研究中，来自中国中山大学肿瘤防治中心、广州优泽生物技术有限公司、华中科技大学同济医学院、上海市第一人民医院、四川大学、第四军医大学和澳门科技大学的研究人员使用了一种针对癌症甲基化特征的机器学习算法来诊断结直肠癌。
PLoS Genet：黑猩猩可能进化出对HIV前体的抵抗力
2019年12月15日讯/生物谷BIOON/---猿猴免疫缺陷病毒（SIV）是一种感染猴子和猿类的病毒。人类免疫缺陷病毒（HIV）起源于SIV。在一项新的研究中，来自英国伦敦大学学院的研究人员发现SIV可能影响着黑猩猩的遗传。他们报道这种病毒是导致不同黑猩猩亚种之间差异的主要原因。尽管黑猩猩并未受到猿猴免SIV的严重影响，但是这些研究结果表明某些黑猩猩亚种可
从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以及染色体断裂区分布等染色体进化规律。为探
Life Science Alliance：深度学习算法有助于鉴定癌细胞的分子特征
根据发表在《Life Science Alliance》杂志上的新研究，一种新的深度学习算法可以快速，准确地分析来自结直肠肿瘤的几种基因组数据，以进行更准确的分类，从而有助于改善诊断和相关的治疗选择。
Genome Biol：人工智能算法——基因组研究的“瑞士军刀”
2019年12月1日 讯 /生物谷BIOON/ --每个分子遗传学家都希望找到一个易于使用的程序，可以比较来自不同细胞条件的数据集，识别增强子区域，然后将其分配给目标基因。 如今，柏林马克斯·普朗克分子遗传学研究所的马丁·温格隆（Martin Vingron）领导的研究小组现已开发出一个掌握所有这些内容的程序。 “ DNA非常无聊，因为它在每个细胞中几乎都一样。如果将基因组比作生命之书，
研究利用迁徙进化实验揭示合成生物建构原理
11月7日，《自然》（Nature）杂志以长文形式发表了中国科学院深圳先进技术研究院、深圳合成生物学创新研究院研究员刘陈立实验室和加州大学圣地亚哥分校教授华泰立实验室的合作成果《空间扩展生境定植的进化稳定性策略》(An evolutionarily stable strategy to colonize spatially extended habitats)。该研究将空间
Nature: 同其它细菌共进化可保条件病原菌自身毒力
近日，英国埃克塞特大学的研究人员在Nature上发表了题为“Bacterial biodiversity drives the evolution of CRISPR-based phage resistance”的文章，在自然环境中进化的细菌可能对噬菌体治疗具有抵抗力，而不会丧失其毒性。据不完全统计，约半数细菌携带CRISPR-Cas适应性免疫系统的基因，该系统通过将来源
研究揭示古多倍化对被子植物适应性进化的贡献
多倍化（polyploidy）或全基因组加倍（whole genome duplication， WGD）事件使基因组内的所有基因都发生重复，为生物进化提供了原始的遗传材料，被认为是进化的加速器。多倍体植物广泛存在于自然界中，如日常生活中的棉花、小麦、油菜等。前期研究发现多倍化在有花植物进化过程中尤其频繁，而且在现存的被子植物和种子植物分化之前，曾分别发生过加倍事件，可能对
eLife：细菌的生活方式或会改变其抗生素耐药性的进化方式
2019年11月9日 讯 /生物谷BIOON/ --不管是作为独立细胞亦或者是作为生物膜群体，细菌的生存决定了其是否会进化出抗生素耐药性，这或许有望帮助研究人员开发出个体化的抗菌疗法和感染控制策略；近日，一项刊登在国际杂志eLife上的研究报告中，来自匹兹堡大学的科学家们重复地将细菌暴露于抗生素环丙沙星中来促进其快速进化，正如研究者预想的那样，细菌对环丙沙星产生了耐药性，但意外的是，细菌的生活方式
Dev Cell：关键蛋白的进化学见解有助于开发治疗囊性纤维化的方法
2019年11月4日 讯 /生物谷BIOON/ --根据最近在《Developmental Cell》杂志上发表的一项研究，大约在4.5亿年前，在一种生活在海底的名叫“海鳗”的鱼类中存在最古老的离子通道蛋白同源分子，而它在人类中的同源蛋白“CFTR”在囊性纤维化患者中存在缺陷。 事实上，这种存在于海鳗中的离子通道蛋白分子与脊椎动物同源蛋白“CFTR”之间仍存在许多差异，一方面反映了转运蛋