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Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理

通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。

2024-09-26

转录因子早期生长反应3 (Egr3)是心脏瓣膜形态发生所需的机械敏感转录因子基因

本研究揭示了一个以前未知的信号轴,其中EGR3是转导心脏瓣膜形成所需的机械信号所必需的,也可能是左室AD瓣膜重塑所需的机械信号。

2024-05-27

Nature:我国科学家揭示脊椎动物旁着丝粒异染色质起始的保守机制

这项新的研究揭示了组成性旁着丝粒异染色质的从头建立机制,并解释了为什么脊椎动物中明显非保守的旁着丝粒异染色质序列仍然具有相同的组蛋白H3K9me3修饰。

2024-07-15

大学池塘中的神奇生物,基因转录规则“与众不同”

DNA就像建筑物的蓝图,它本身不做任何事情但下达必要的指令。为了让基因产生影响,必须先读取DNA,再将其构建成具有物理效应的分子。

2024-07-15

研究揭示哺乳动物生命起始时期的脂代谢重塑

该研究描绘了小鼠和人早期胚胎脂质全景图,为探讨哺乳动物植入前胚胎发育中内源性脂质的重塑提供了资源,并为脂质不饱和度调节胚胎发育和植入提供了机制上的新见解。

2024-02-23

Cancer Cell:王存/高强/覃文新团队提出免疫治疗新策略——靶向肿瘤起始细胞免疫特权,增强癌症免疫治疗

研究团队提出联合靶向PD-1和CD155的治疗策略,不仅能够清除这些肿瘤起始细胞,还能减少肿瘤微环境中免疫抑制性中性粒细胞的浸润。

2024-11-20

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20

Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序:揭示转录组分析新前沿

LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具,提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。

2024-06-12