Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
Nature Communications:合成BZLF1靶向转录激活剂用于EBV相关性上皮性癌的高效裂解诱导治疗
在这项概念验证研究中,研究者成功地开发了一种用于EBV相关上皮性癌的裂解诱导治疗的一流信使核糖核酸药物。
科研人员发现内涵体上GPCR-G蛋白信号转导的分子调控新机制
该研究利用免疫沉淀-质谱联用技术和荧光共定位等实验方法,发现SNX25的PX结构域可以结合一些经典的RGS蛋白,如RGS2、RGS4、RGS8和RGS17。
研究揭示RAS棕榈酰转移酶调控机制
该研究报道了催化RAS棕榈酰化的人源酰基转移酶DHHC9-GCP16及酵母同源蛋白Erf2-Erf4复合物的冷冻电镜结构,阐释了辅助蛋白对酰基转移酶的调控作用。
Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达
Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。
清华大学陈春来/刘俊杰团队揭示CasX靶标搜索和切割过程的动态调控机制
CasX独特的NTSB结构域在DNA解旋和R-loop形成中发挥了重要功能。这一动态模型深化了我们对CasX工作机制的理解,并为CasX以及其他Cas蛋白的优化和改造提出了新的思路和策略。
Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具,还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。
Nat Commun :哺乳动物活细胞内可编程重构RNA调控网络的人工基因线路
研究团队首次将原本不可检测的单点突变RNA感应由1.5倍提升至94倍。由此,成功实现单碱基突变的检测,也将RNA表达量的感应扩展至序列变化的感应,极大地丰富了RNA-IN模块的识别范围。
Cell:微胶质细胞衍生的C1q调控衰老大脑蛋白质稳态的新机制
这一系列实验结果共同证明了C1q在衰老大脑中的新功能,并突显了微胶质细胞和补体蛋白在神经元功能和认知健康中的重要性。
Nat Chem:陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能多样性
该研究首次系统地揭示了内源性三链体DNA调控蛋白的全景图,不仅为深入理解三链体DNA的动态调控奠定了基础,也为诸多蛋白的分子功能研究提供了全新视角。