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Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物格局!深度学习与空间转录的完美结合

GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。

2025-02-01

Nat Commun:通过整合细胞形态和空间转录深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

Cell:新研究揭示考拉对考拉逆转录病毒的基因免疫

逆转录病毒可导致严重疾病,并在塑造人类进化方面发挥了显著作用。

2025-03-17

Nature Genetics:任善成/谌科/古迪团队绘制首个成年人前列腺空间转录图谱,揭示前列腺新的生理功能和癌变机制

该研究构建了首个高分辨率成年人前列腺空间图谱,系统解析了前列腺的空间异质性与细胞组成。

2025-04-04

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录实时测序新技术

该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。

2024-11-03

大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应

这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。

2024-12-27

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

研究发现逆转录酶通过重编辑温和噬菌体的基因赋予其超感染能力

研究证实,添加逆转录酶抑制剂能够抑制生物膜中超感染噬菌体的产生。

2024-11-03

Cell:单胚胎蛋白质突破——助力不孕不育诊断与个性化治疗

运用超灵敏蛋白质组学(ultrasensitive proteomics)技术,对人类卵母细胞及早期胚胎的蛋白质谱进行了系统解析,检测到了近8000种蛋白,并揭示了这些蛋白在不同发育阶段的变化模式。

2025-02-02