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清华大学生命学院杨雪瑞课题组开发深度学习工具DeepLinc,使用单细胞空间转录组数据构建细胞互作网络

DeepLinc针对单细胞空间转录组数据,提出新的方法理论,通过新型深度学习模型的创新应用,挖掘细胞分子特征谱图与复杂生理与病理组织之间的多层级复杂关联,充分释放单细胞空间组学分析的优势与潜力。

2022-06-13

Genomics:揭示莱茵衣藻m6A表观转录组图谱

阐明了莱茵衣藻有性生殖过程中m6A表观转录组与转录组的特征,并发现m6A修饰广泛存在于莱茵衣藻的转录本中

2022-05-19

研究揭示具有RNA结合活性的水稻转录因子可调控细胞死亡和抗病性

该研究揭示植物转录因子通过在细胞核和细胞质中穿梭协同调控免疫反应的新机制,为水稻病害防控策略的开发提供新思路。

2022-05-23

B3GNT5转录和糖基化水平升高促进乳腺癌侵袭性

基底细胞样乳腺癌(BLBC)是乳腺癌中侵袭性最强的亚型,具有侵袭性,且无有效的靶向治疗药物。然而,其攻击性行为背后的机制仍然知之甚少。

2022-05-25

中科院微生物所合作构建非洲猪瘟病毒感染的全景式细胞转录图谱

该项研究报道了ASFV感染巨噬细胞的单细胞转录组图谱研究,揭示了病毒调控宿主细胞的重要信号通路。

2022-05-09

Science:利用单细胞eQTL定位确定自身免疫性疾病的细胞类型特异性基因控制

人类的免疫系统已经进化到通过调节专门的细胞群体来维持组织稳态和靶向外源性病原体。它在不同个体之间显示出巨大的差异,决定了人们对疾病易感性和对病原体或癌症的反应是如何不同。

2022-04-09

叉头盒转录因子:癌症中的双刃剑

目前癌症治疗的选择包括手术、放射治疗、化疗,以及最近开发的靶向免疫疗法和检查点封锁疗法。放疗和化疗都有过多的局限性,包括需要权衡临床益处和毒性的副作用,以及肿瘤内异质性可能导致的耐药性的出现。

2022-03-31

Nature及其子刊首次揭示转录偶联修复在细菌DNA损伤修复中起着至关重要的作用

与传统观点相反的是,第一项研究发现RNA聚合酶是整个NER复合物组装的支架,也是DNA损伤的主要传感蛋白。

2022-04-11

Cancer Research: 癌症先天免疫的表观遗传和转录调控

天然免疫细胞通过模式识别受体介导的复杂信号通路参与肿瘤细胞的检测,如Toll样受体(TLR)和Nod样受体(NLR)。这些途径通过多种机制进行微调,包括表观遗传调节。众所周知,造血祖细胞产生先天免疫细胞,可调控癌细胞行为,病理状态下正常造血功能的破坏可能导致免疫改变和癌症的发生。

2022-03-31

Science:利用单细胞RNA测序揭示系统性红斑狼疮的细胞类型特异性分子关联和遗传关联

系统性红斑狼疮(SLE)是一种异质性的自身免疫性疾病,在女性和亚洲、非洲和西班牙血统的人中发病率较高。bulk转录组分析表明,1型干扰素信号的增加、淋巴细胞激活失调和细胞凋亡清除的失败是这种疾病的标志

2022-04-10