Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录组测序技术
在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。
Nature:中外科学家联手揭示结直肠癌的预后基因组和转录组特征
在这篇首次发表的研究论文中,研究者发现了将近100个发生突变的癌症驱动基因。其中,9 个是结直肠癌中的新型基因,24 个是任何癌症的新型基因。
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
Science:一种诱导胎儿血红蛋白表达的 WIZ 转录因子降解剂有望用于治疗镰状细胞病
镰状细胞病是由负责制造成人血红蛋白的基因突变引起的。这种基因突变导致红细胞畸形(形成新月形,而不是圆盘形),进而导致氧气运输问题和细胞粘连在一起,从而引起疼痛。
科研人员描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱
该研究利用高精度大视场时空组学Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,系统描绘了小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱。
Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础
Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。
Journal of Advanced Research: 转录组关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路
研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。
Cancer Res:转录因子BHLHE40是转移性结直肠癌EMT的驱动因素
来自南京医科大学第一附属医院普外科的研究者们在Cancer Res杂志上发表了题为“Cancer Res”的文章,该研究揭示了BHLHE40是调节上皮-间充质转化促进结直肠癌肝转移的关键转录因子。
Nat Commun | 叶海峰/管宁子:探索植物源光敏色素伴侣蛋白助力哺乳动物光开关转录调控
团队开发了一种光开关平台,能够实现基因转录的正交、模块化和可调控的控制,并将其整合到PTRC控制的CRISPRa系统(PTRCdcas)中,以调节内源基因的表达。
Cell Mol Immunol:新研究发现XPO1蛋白控制肿瘤中髓源性抑制细胞的免疫抑制功能
研究结果表明,美国 FDA 批准的 XPO1 抑制剂塞利尼索部分上通过阻断 MDSC、诱导具有抗肿瘤能力的中性粒细胞样细胞以及增强抗肿瘤免疫反应来减少肿瘤进展。