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转录组层面上研究蛋白质-RNA相互作用的技术及方法综

两周前,小编给大家推荐了清华大学张强峰教授在QB期刊上发表的关于转录组层面上研究RNA-RNA相互作用的干湿实验方法的综述文章后(点击这里进入该篇文章),引起了许多小伙伴的关注。并且也有小伙伴问,RNA在转录组层面上的相互作用不仅有RNA-RNA之间的,应该还有蛋白质-RNA之间的相互作用呢!那关于RNA-蛋白质相互作用的研究进展又如何呢?     

2018-11-23

研究发现转录因子KLF5参与小鼠乳腺干细胞维持及乳腺发育

 乳腺癌是女性中发病率最高的癌症。全球乳腺癌发病率自20世纪70年代末开始一直呈上升趋势。美国8名妇女一生中就会有1人患乳腺癌。中国不是乳腺癌的高发国家,但不宜乐观,近年我国乳腺癌发病率的增长速度却高出高发国家1~2个百分点。据国家癌症中心和卫生部疾病预防控制局2012年公布的2009年乳腺癌发病数据显示:全国肿瘤登记地区乳腺癌发病率位居女性恶性肿瘤的第1位,女性乳腺癌发病率(粗率)全国

2018-11-22

Nat Commun:在抗逆转录病毒治疗期间,大多数HIV病毒的持续存在是由于受感染细胞的增殖

2018年11月25日/生物谷BIOON/---根据一项新的研究,即时在接受抑制性的抗逆转录病毒药物(ART)治疗期间,大多数受到HIV感染的细胞仍然存在于HIV感染者体内,这些受感染细胞来自细胞增殖,而不是病毒复制。相关研究结果于2018年11月16日发表在Nature Communications期刊上,论文标题为“A majority of HIV persistence during an

2018-11-25

EV71 m6A修饰调控病毒复制方面取得进展

  N6-methyladenosine(m6A)是一种含量最为丰富的mRNA修饰,在RNA代谢及功能中发挥重要作用。早在40年前已经发现RNA病毒基因组含有m6A修饰,但是其功能未知,直到最近才有研究报道m6A修饰影响艾滋病病毒、乙肝病毒和寨卡病毒感染与复制。目前关于病毒m6A修饰及功能的研究较少且分子机制不清楚。近期,中国科学院武汉病毒研究所研究员关武祥和邓菲课题组在肠道病

2018-11-08

QB期刊 |转录组层面上RNA-RNA相互作用(RRI)的研究进展及机遇综述

最近关注CNS的同学们一定对“Phase Separation”这个词相当眼熟。这个单词翻译成中文就是“相变”或“相分离”。对,你没有看错,就是这个物理化学领域的术语。但最近,这个术语在生命科学领域也掀起了“热浪”。因为据不完全统计,从2018年1月到现在,关于该方面的研究已经有20多项工作分别发表在了Science、Nature或Cell上(对这个领域还不知道的同学,赶紧点击这里,先脑补一下哦

2018-11-09

Gotham成立 表观转录组学进入转化阶段

  10月11日,纽约的Gotham Therapeutics获得5400万美元A轮投资,正式挂牌成立。Gotham的技术平台是表观转录组学(epitranscriptomics)、即调控RNA的化学修饰。Gotham主要关注一种叫做m6A(6-甲基腺苷)的常见mRNA修饰,这个修饰在RNA代谢中起到关键作用、与多种疾病相关。这是继今年五月Accent Therapeutics

2018-10-11

Nature:利用CRISPR/Cas系统开发出一种存储转录事件的细胞记录设备

2018年10月5日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院和巴塞尔大学的研究人员利用CRISPR-Cas系统开发出一种新的记录设备:它产生的DNA片段能够提供关于某些细胞过程的信息。在未来,这种细胞存储设备甚至可能用于诊断中。相关研究结果于2018年10月3日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“Transcriptional recording by CRIS

2018-10-05

破解DNA复制之谜!鉴定出蛋白GapR识别过度扭曲的DNA结构

2018年9月24日/生物谷BIOON/---DNA是一种冗长的分子,比它所在的细胞长大约1000倍,因此不能随意地将它塞到细胞中去。相反,它必须整齐地加以组装,这样参与关键过程的蛋白就能够访问DNA中的碱基包含的信息。可以将双螺旋DNA想象成一对缠绕在一起的鞋带,一次又一次自我缠绕着,从而让它变得更加紧凑。然而,当涉及细胞分裂时,这种超螺旋性质使得参与DNA复制的蛋白难以接近两条DNA链,将它们

2018-09-24

Gene & Dev:揭开癌细胞复制的秘密

2018年9月1日 讯 /生物谷BIOON/ --南卡罗来纳医科大学霍林斯癌症中心的科学家发现,一些细胞可以在必要因子存在的情况下分裂。他们的结果发表在2018年7月的《Gene & Development》杂志上。这一发现解释了肝细胞在受伤后如何再生,以及可以帮助我们了解癌症是如何产生的,以及癌细胞如何进化以产生额外的突变,从而加速生长和扩散。该论文的作者包括Hollings癌症中心主任

2018-09-01

利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性

2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化,因此染色质可接近性有

2018-09-06