科学家绘制正常组织DNA甲基化单体图谱
石建涛研究组定义了新的DNA甲基化单体格式mHap,并开发了相应的分析工具mHapTk和数据库mHapBrowser,使得大规模、高效的整合分析成为可能。
Nat Biotechnol | RNA结构解析新纪元:一种全新的自动化、高效率的冷冻电镜图谱分析方法
该研究开发了一种基于深度学习的方法,从冷冻电镜图中自动构建全长全原子RNA结构,称为EMRNA。
Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质
近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。
Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子
该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。
Dev Cell | 同济大学陈嘉瑜/高绍荣/江赐忠/高睿等揭秘TFAP2C在小鼠着床期间转录因子网络的中心角色
该研究清楚地阐明了以TFAP2C为中心的TF网络对早期胚胎发育的微调调控,该网络连接配子遗传代谢基因、亲本遗传环境和表观基因组,共同调节早期胚胎发育。
Cell子刊:李汉杰/陈昶/王光锁/陈云团队绘制早期肺腺癌免疫动态图谱,揭示Tfh细胞抗肿瘤机制
在这项研究中,为了阐明肺腺癌发展过程中的免疫动态和调节机制,研究团队对34个正常肺样本、4个浸润性原位腺癌、22个微浸润性腺癌等的免疫浸润进行了时间分辨单细胞RNA测序分析。
Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录组学变化及FOXP1的调控作用
该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。
Nature:首次构建出小鼠全脑细胞类型图谱
在一项新的研究中,来自美国哈佛大学和艾伦脑科学研究所的研究人员通过在分子水平上对哺乳动物大脑的数千种不同细胞类型进行分类和绘图,比以往任何时候都更深入地研究了哺乳动物的大脑。相关研究结果于2023年1
华中科技大学研究者们揭示了核AGO2通过激活ANKRD1转录促进衰竭心脏心肌重塑
本研究结果表明,在压力超负荷诱导的衰竭心脏中,核AGO2表达上调,它在细胞核中作用于ANKRD1转录。ANKRD1具有双面性,胞浆形式位于肌节的I带区域,而胞浆形式诱导病理性MYH7激活和心脏重塑。
Sci Transl Med:科学家绘制出人类足月分娩期间机体胎盘组织的单细胞图谱
研究人员通过利用单细胞RNA测序(也称为单细胞转录组学)创建了胎盘图谱,该图谱能分析单一细胞的活性和型号模式。