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Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

Science:对发育中的人类大脑进行测序或能揭示成千上万种新型基因转录

这项研究具有较强的治疗性意义,而且研究人员也能在临床上采取行动,而揭示新的转录物或能帮助在基因疗法试验中识别出新型疗法策略,并为携带罕见突变且与精神性或神经发育障碍相关的个体进行靶向性的临床试验。

2024-06-05

Nat Neurosci:科学家构建单细胞表观基因组图谱,揭示调控细胞命运的关键“开关”

本研究中构建的人类神经类器官发育的单细胞表观基因组图谱,为深入了解人类细胞命运选择提供了宝贵的参考蓝本。

2024-07-22

Cancer Res:转录因子BHLHE40是转移性结直肠癌EMT的驱动因素

来自南京医科大学第一附属医院普外科的研究者们在Cancer Res杂志上发表了题为“Cancer Res”的文章,该研究揭示了BHLHE40是调节上皮-间充质转化促进结直肠癌肝转移的关键转录因子。

2024-05-19

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制

该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。

2024-07-04

Nature Genetics:清华大学刘念团队发现转座子LINE-1转录选择性激活远程基因表达

该研究提供了功能多样的LINE-1表达调控因子,发现并验证了LINE-1 5' UTR作为增强子在早期胚胎发育阶段通过转录依赖的方式直接与ZGA基因相互作用激活基因表达。

2024-06-11

Cell:新研究首次构建出人类串联重复序列扩增的遗传参考图谱

这个开创性的项目弥补了解释遗传疾病患者中串联重复序列扩增能力方面的重大空白!

2024-04-25

Nature子刊:颉伟/李晶团队揭示增强子在卵子发生及早期胚胎发育中的转录调控机制

研究团队鉴定了哺乳动物卵子到早期胚胎中活跃增强子网络,揭示了其不同于成体细胞的重要特征。

2024-06-09

Nature Aging:中山大学张宏波团队绘制人类骨骼肌衰老图谱

该研究首次发现肌肉的一些代偿机制似乎可以弥补这种损失,包括慢缩型肌纤维的转变,以表达损失的快缩型肌纤维的特征基因,以及增加剩余快缩型肌纤维亚型的再生。

2024-04-20

Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质可及性图谱

SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。

2024-07-16