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Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关

该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。

2024-07-20

Nat Commun :上海药物所揭示E6AP活性动态调控分子机制

该研究利用冷冻电镜技术分别解析了E6AP和E6结合E6AP不同构象复合物结构,并结合分子动力学模拟分析和生化实验,系统揭示了E6AP活性动态调控的分子机制。

2024-05-15

EMBO:徐安龙、万刚团队合作揭示ZNFX1在病毒感知与炎症调控中的双重角色

本研究揭示了ZNFX1在病毒感知和炎症抑制中的双重作用,为治疗ZNFX1突变相关疾病提供了新的见解,即可能通过NLRP3炎症小体通路抑制剂来治疗该遗传疫病。

2024-10-06

Science:利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序

多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。

2024-09-27

刘毓文/倪建泉团队开发基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法

DREAM兼具超高的元件活性性能预测能力以及良好的生物学可解释性,因此DREAM可以将学习到的增强子的调控语法用于后续的元件设计任务之中。

2024-11-27

研究揭示USP1-ATF4-CD98hc调控ENKTL淋巴瘤患者耐药的新机制

本研究表明,sEVs中的CD98hc蛋白可作为监测淋巴瘤进展和耐药的临床标志物,为靶向肿瘤来源的sEVs和sEVs中的CD98hc蛋白治疗ENKTL提供了理论依据。

2024-11-26

研究揭示RAS棕榈酰转移酶调控机制

该研究报道了催化RAS棕榈酰化的人源酰基转移酶DHHC9-GCP16及酵母同源蛋白Erf2-Erf4复合物的冷冻电镜结构,阐释了辅助蛋白对酰基转移酶的调控作用。

2024-03-14

科研人员发现内涵体上GPCR-G蛋白信号转导的分子调控新机制

该研究利用免疫沉淀-质谱联用技术和荧光共定位等实验方法,发现SNX25的PX结构域可以结合一些经典的RGS蛋白,如RGS2、RGS4、RGS8和RGS17。

2024-07-04

清华大学陈春来/刘俊杰团队揭示CasX靶标搜索和切割过程的动态调控机制

CasX独特的NTSB结构域在DNA解旋和R-loop形成中发挥了重要功能。这一动态模型深化了我们对CasX工作机制的理解,并为CasX以及其他Cas蛋白的优化和改造提出了新的思路和策略。

2024-07-15

研究揭示调控抗病毒天然免疫应答的“油门”和“刹车”机制

该团队以草鱼为研究对象,剖析了SIRT3在草鱼抵御草鱼呼肠孤病毒感染时的作用。

2024-04-23