Science：利用单细胞染色质可及性图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序
多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型，为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。
2024-09-27
Nature | 记忆的社交维度：大脑皮层杏仁核对食物偏好记忆的调控机制
该研究通过多种实验手段，详细探讨了COApm在STFP记忆巩固中的关键作用，揭示了其通过整合社交和感官嗅觉输入，介导蛋白质合成依赖的记忆巩固机制。
2024-07-10
Nature Genetics：基因调控的精准地图：ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
ChIP-DIP技术的出现，为基因调控的研究打开了一扇全新的大门。通过并行分析多个蛋白质-DNA相互作用，ChIP-DIP不仅显著提高了研究效率，还揭示了基因调控网络的复杂性和动态性。
2024-12-05
Nature子刊：浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型，预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具，还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。
2024-11-01
Nat Commun ：哺乳动物活细胞内可编程重构RNA调控网络的人工基因线路
研究团队首次将原本不可检测的单点突变RNA感应由1.5倍提升至94倍。由此，成功实现单碱基突变的检测，也将RNA表达量的感应扩展至序列变化的感应，极大地丰富了RNA-IN模块的识别范围。
2024-11-02
Nature Genetics：基因调控的精准地图——ChIP-DIP技术开启蛋白质-DNA相互作用的新纪元
通过将多种蛋白质与DNA的结合关系同时映射，ChIP-DIP 为我们提供了一个全新的视角，使得研究人员可以在一个实验中并行检测多个蛋白质的DNA结合模式，从而更加全面、精确地揭示基因调控的动态变化。
2024-12-09
Neuron | 朱英杰团队发现外侧隔核脑区调控奖赏和甲基苯丙胺成瘾的关键机制
VTA-NAc通路是经典奖赏系统的核心，以往研究表明，自然奖赏（如美食和社交）和毒品（甲基苯丙胺等）都可以增加NAc脑区的多巴胺水平。
2024-07-12
Nat Chem：陈加余团队系统揭示三链体DNA互作蛋白调控机制与功能多样性
该研究首次系统地揭示了内源性三链体DNA调控蛋白的全景图，不仅为深入理解三链体DNA的动态调控奠定了基础，也为诸多蛋白的分子功能研究提供了全新视角。
2024-09-08
Nature Methods | 解码基因调控新机制：系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性，并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来，SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中，揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。
2024-07-20