COVID-19传播的计算机模型如何帮助我们对抗病毒
2020年3月11日讯 /生物谷BIOON /——利用数学和计算机模拟传染病传播过程的科学家正在研究这种新型冠状病毒，试图预测这种全球疫情可能如何演变，以及如何最好地应对。但有些人说，利用这些建模工具和研究人员的发现，还可以做更多的工作。"这是一种临时的、自愿的努力，我认为这是我们可以改进的地方，"约翰霍普金斯卫生安全中心的传染病建模师Caitlin Rive
联合全世界闲置计算机来研究新冠病毒，斯坦福推出新项目
全世界闲置的计算机联合起来！日前，由斯坦福大学潘德实验室（Pande Lab）主持的Folding@home分布式计算项目，正式向全世界发出邀请，寻找志愿者利用家里闲置的计算机，帮助研究人员开发新型冠状病毒的治疗方法。Folding@home（简称FAH）成立于2000年10月1日，是一个研究蛋白质折叠、误折、聚合及由此引起的相关疾病的分布式计算
华大智造 “超级生命计算机”DNBSEQ-T7 正式交付
2019年9月9日，由深圳华大智造科技有限公司（以下简称“华大智造”）自主研发的超高通量基因测序仪——DNBSEQ-T7正式交付商用，首批测序仪已抵达华大基因科技服务有限公司和微基因（WeGene）等合作伙伴的实验室。来自交付前的用户测试数据表明，T7数据表现符合预期，各项指标均表现良好。作为“全球日生产能力最强”的基因测序仪，DNBSEQ-T7自发布就拥有多个“光环”：“首个4联芯片的测序平台”
PLOS Med：计算机辅助诊断程序让医生更早发现脑肿瘤的生长
2019年6月3日讯 /生物谷BIOON /——根据近日发表在开放获取杂志《PLOS Medicine》杂志上的一项新研究，一种计算机辅助诊断过程可以帮助医生更准确地发现较低级和体积比较小脑部肿瘤的生长，该研究由来自伯明翰阿拉巴马大学的Hassan Fathallah-Shaykh及其同事们一起完成。然而，还需要更多的临床研究来确定早期肿瘤生长检测所支持的早期治疗干预是否能延长患者的生存时间并改善
Gen Res：新型计算机工具有助于基因鉴定
2019年5月9日 讯 /生物谷BIOON/ --就像在大海捞针一样，识别与特定疾病有关的基因可能是一个艰巨而耗时的过程。为了改善这一过程，由贝勒医学院的研究人员领导的团队开发了一种新的生物信息学工具，可以分析CRISPR合并的筛选数据，并以比其他现有方法更高的灵敏度和准确度确定潜在相关基因的候选基因。新的基于网络的分析工具也更快，更友好，因为它不需要生物信息学培训来使用它。该研究发表在《Geno
Sci Rep：计算机成像技术揭示肿瘤内血流信号
2019年5月7日 讯 /生物谷BIOON/ --约翰·霍普金斯大学医学研究人员表示，他们开发了一种类似于“谷歌地图”的方法，可以更准确地计算和可视化肿瘤生长所需的结构和功能性血管变化。通过将来自动物模型的肿瘤标本的高质量3D成像数据与复杂的数学公式配对，研究人员表示，他们现在拥有一个能够准确表示肿瘤内血液流量的模型，包括复杂的血流量，氧合作用和发生的结构变化。这项工作于3月27日在Nature
基于人工智能和计算机辅助药物设计的研究方法方面获进展
近日，中国科学院深圳先进技术研究院医药所计算机辅助药物设计中心袁曙光课题组带领团队，利用人工智能和计算生物学的方法从158万个化合物中寻找到了17个嗅觉受体蛋白Olf73的活性药物分子。该工作为基于嗅觉受体蛋白的药物发现与设计提供了有力的理论基础和依据。该成果以Computational modeling of the olfactory receptor Olfr73 suggests a mo
JCIM：人类激酶计算机模型有望帮助开发新型癌症疗法
2019年4月8日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究报告中，来自加州理工州立大学的科学家们通过研究开发了一种人类MEK1蛋白计算机模型，MEK1是科学家们有望开发多种人类癌症疗法的潜在药物靶点。图片来源：theconversation.com当参与细胞增殖的分子信号错误时，癌细胞就
Nat Chem：超级计算机帮助“组装”大型蛋白质复合体
2019年4月1日 讯 /生物谷BIOON/ --红细胞中的血红蛋白分子通过以全有或全无的方式改变其形状来传输氧气。血红蛋白中相同蛋白质的四个拷贝像花瓣一样打开和关闭，在结构上相互耦合以相互作用。使用超级计算机，科学家们能够设计自组装的蛋白质，以组合和类似生命的分子，如血红蛋白。科学家表示，他们的方法可以应用于有用的技术，如药物靶向，人工能量收集，“智能”传感和建筑材料等。一个科学团队通过增加蛋白