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AJHG:计算生物学所研究人员建立了研究人群基因交流历史和混合动力学机制的新方法

国际著名学术期刊《美国人类遗传学杂志》(AJHG)在线发表了上海生命科学研究院计算生物学所徐书华课题组的最新研究成果Exploring Population Admixture Dynamics via Empirical and Simulated Genome-Wide Distribution of Ancestral Chromosomal Segments。

2012-11-18

Cell Reports:新计算模型揭示Sec蛋白通道功能

2012年10月20日 讯 /生物谷BIOON/ --在细胞中,Sec转位通道(Sec translocon)允许特异性的蛋白通过细胞膜。来自美国加州理工学院的研究人员首次模拟出Sec转位通道的生物学功能。这项成就需要将纳秒范围的时间尺度提高至分钟范围的时间尺度,比早期的模拟研究提高了六个多数量级。这项研究结果有助于人们详细地理解这种转位通道发挥功能的分子机制。

2012-10-22

JACS:晶体学和计算机模型技术揭示细菌对抗生素耐药的分子机制

2012年11月14日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,刊登在国际杂志Journal of the American Chemical Society (JACS)上的一篇研究报告中,来自布里斯托大学和葡萄牙阿威罗大学的研究者通过研究揭示了一种特定酶的结构,这种酶可以破坏碳青霉烯类抗生素,抑制抗生素发挥作用,这种抗生素可以抑制一系列的严重感染。

2012-11-18

CSB:基于原子力显微镜微切削加工技术的癌细弹性模量计算

来自哈尔滨工业大学,哈尔滨医科大学的研究人员跨学科完成了卵巢癌细胞(UACC1598)和结肠癌细胞(NCI-H716)微切削逐层去除,证明了这种这种微切削去除方法可以测量细胞内部细胞骨架细胞器等各结构的力学特性,为疾病的诊断和治疗提供更精确的实验数据。这一研究成果公布在最新一期《科学通报》上。 细胞对外界刺激的响应主要依赖于细胞骨架, 细胞骨架由各种尺寸与刚度不同的细丝网组成。

2013-01-03

PLoS ONE:计算系统生物学建模方法研究II型糖尿病

2013年1月6日 讯 /生物谷BIOON/ --当很多科学家调查疾病发生的遗传基础以及突变如何影响人类健康的时候,来自加州大学圣塔芭芭拉分校(UC Santa Barbara)的研究者却在研究机体细胞及其周围组织的代谢来发现特定疾病发病的分子机制,研究者的方法包括计算机模型,其可以用于进行II型糖尿病、自体免疫疾病以及神经变性疾病等疾病的研究。相关研究刊登于国际杂志PLoS ONE上。

2013-01-06

Nature:哺乳动物细胞的生物计算器开发为病人带来福利

研究者重新编程了哺乳动物的细胞以便像袖珍计算机一样使细胞执行逻辑运算的能力。 (Credit: J. Kuster / ETH Zurich) 近日,来自苏黎世联邦理工学院的研究者重新编程了哺乳动物的细胞以便像袖珍计算机一样使细胞执行逻辑运算的能力。这些细胞欠缺一种最为复杂的基因调控网络,于是研究者构架了不同的基因调控网络使其可以进行运算,基于此,细胞可以进行特殊的代谢过程。

2012-11-18

Genome Res:利用计算模型揭示干细胞分化期间染色质结构和转录因子之间相互作用

2012年12月05日 讯 /生物谷BIOON/ --来自瑞士弗雷德里希米歇尔生物医学研究所(Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research) Dirk Schübeler研究团队和来自巴塞尔大学的Erik van Nimwegen 研究团队开展一项重要的原理循证研究(proof-of-principle study)...

2012-12-06

国家人口计生委科学技术研究所成立“生物信息与计算生物学研究中心”

6月13日,国家人口计生委科学技术研究所成立了“生物信息与计算生物学研究中心”。21世纪被称为生物技术和信息技术的时代,生物信息(Bio-IT)产业是生物技术和信息技术相结合的产物,Bio-IT可分为7大领域,即运算与电脑架构、信息工具与资料、储存与资料管理、生命科学应用、生命科学设备、系统整合与资讯以及知识管理与互通。

2012-11-19

:正电子发射型计算机断层显像/CT定位难治性癫痫病灶

部分难治性癫痫患者需要手术治疗或放射治疗,而致痫灶的定位是手术或伽玛刀治疗难治性癫痫的前提。一项关于“Gamma knife treatment for refractory epilepsy in seizure focus localized by positron emission tomography/CT”的研究以18F-氟代脱氧葡萄糖正电子发射型计算机断层显像/CT方法定位难治性癫痫患

2013-01-08

医疗领域人工智能的未来:医用超级计算机

据《财富》杂志报道,数据分析和移动设备是科技领域的两大热门趋势,它们正在走进医院。未来,大型计算机系统可以处理包括医学文献到病人体征在内的数据,据此判别症状。然后,医生就可以借助平板电脑或者智能手机上的智能软件掌握病情,更及时地提供相应的治疗。 数据分析和移动设备这两项高速发展的科技能够帮助诊断包括败血症和癌症在内的多种困扰人们的疾病。

2012-12-18