eLife：使用计算机模拟技术揭示病毒扩散的机制
2013年6月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，刊登在国际杂志eLife上的一篇研究报告中，来自布兰迪斯大学的研究者通过复杂的计算机模型和图形处理单元来揭示病毒结构与其外壳之间基因组数据的复杂关联。研究者Jason Perlmutter表示，我们希望通过此项研究来帮助改变病毒的装配从而使得病毒不能进行复制。
Nature：简化有关活细胞的计算方法
用于合成生物学的新颖基因控制系统的设计受数字逻辑支配。这必然是一种复杂的安排。现在Timothy Lu及其同事利用在自然细胞中所发现的模拟构造单元来在对数范畴内执行算术运算。这样的模拟回路（它们可以与数字回路集成）应能使采用更少的要素来进行在生物感应中要求宽的动态范围的复杂计算成为可能。
Nature Commun：分子建模设计出治疗前列腺癌的小分子
2013年5月29日讯 /生物谷BIOON/--德州大学达拉斯分校化学副教授Jung-Mo Ahn博士成功设计并合成出一种新型的小分子，有可能成为一个新型的武器对抗前列腺癌。 研究论文发表在5月28日的Nature Communications杂志上，Ahn和得克萨斯大学西南医学中心同事在论文中描述了分子的合理设计，以及实验室测试表明其具有阻断促癌蛋白质雄激素受体功能的成效。
Astellas将利用超级计算机开展NTDs药物发现
2012年7月30日讯 /生物谷BIOON/ --安思泰来（Astellas）今天宣布，与东京工业大学签署药物发现联合研究协议，利用东京工业大学千万亿次超级计算机Tsubame 2.0，有效地发现候选药物，用于治疗由原生寄生虫（protozoan parasites）引发的疾病。
PLoS Comput Biol：药物动力学建模证实一些酶有望治疗可卡因滥用
来自美国肯塔基大学的研究人员设计和发现一系列高度有效的酶，而且它们能够有效地代谢可卡因。这些高活性的可卡因代谢酶能够潜在地阻止可卡因产生生理影响，从而可能有助于治疗药物依赖症。相关研究结果发表在PLOS Computational Biology期刊上。 研究人员通过建立可卡因药物动力学模型和当这些酶在体内存在时，研究注射的诸如可卡因之类的外来物质在体内的作用，来评估这些酶的有效性。
云计算结合即时诊断 开拓百亿美元大市场
原文发表于福布斯中文网。作者在原有内容基础上做了相关调整。 图片来源：福布斯中文网 我们正处于一个“云端时代”。云计算被认为是继个人计算机变革、互联网变革之后的第三次科技浪潮。它与各行业的结合正加速行业变革，比如说云医疗。 随着医疗行业发展，诊断也日新月异。传统的检测诊断，需要在检测中心、实验室、大型仪器分析后获得检测结果。相比于即时检验的简便、快速、高效及低成本，它们相形见绌。
PNAS：利用硅片计算工具揭示纳米颗粒抑制胰腺癌转移机制
2012年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --医学界在设计和开发治疗诸如胰腺癌之类的致命性疾病的药物中获得新的深入认识和新的策略。通过利用硅片(in silico)计算工具来补充体外和体内实验的研究结果，研究人员在原子水平上理解纳米颗粒抑制胰腺瘤生长和转移的机制。
AJHG:计算生物学所研究人员建立了研究人群基因交流历史和混合动力学机制的新方法
国际著名学术期刊《美国人类遗传学杂志》（AJHG）在线发表了上海生命科学研究院计算生物学所徐书华课题组的最新研究成果Exploring Population Admixture Dynamics via Empirical and Simulated Genome-Wide Distribution of Ancestral Chromosomal Segments。
Cell Reports：新计算模型揭示Sec蛋白通道功能
2012年10月20日 讯 /生物谷BIOON/ --在细胞中，Sec转位通道(Sec translocon)允许特异性的蛋白通过细胞膜。来自美国加州理工学院的研究人员首次模拟出Sec转位通道的生物学功能。这项成就需要将纳秒范围的时间尺度提高至分钟范围的时间尺度，比早期的模拟研究提高了六个多数量级。这项研究结果有助于人们详细地理解这种转位通道发挥功能的分子机制。
JACS：晶体学和计算机模型技术揭示细菌对抗生素耐药的分子机制
2012年11月14日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，刊登在国际杂志Journal of the American Chemical Society (JACS)上的一篇研究报告中，来自布里斯托大学和葡萄牙阿威罗大学的研究者通过研究揭示了一种特定酶的结构，这种酶可以破坏碳青霉烯类抗生素，抑制抗生素发挥作用，这种抗生素可以抑制一系列的严重感染。