Science封面:华人学者开发AI模型,学会生命的语言,生成新型CRISPR系统乃至整个基因组
该研究开发了从分子到基因组尺度都能进行预测和生成任务的基因组基础模型——Evo模型。这是第一个在全基因组规模上以单核苷酸分辨率预测和生成DNA序列的模型。
2024-11-23
大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。
2024-12-27
Nat Med | 翟冰课题组等发现真菌异质性耐药导致突破性血流感染
为了探索临床菌株中出现米卡芬净异质性耐药的普遍性,作者检测了来自美国、中国、法国、德国不同医疗机构的共219株近平滑念珠菌对米卡芬净的药敏表型,并对所有菌株都进行了深度全基因组测序。
2024-08-06
Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱
该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。
2024-08-27
Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。
2024-07-20
科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库
该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB(http://www.cucumberdb.com/),囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。
2024-06-26
Nat Chem Biol | 叶存奇课题组发现磷脂合成调节核苷酸代谢和细胞还原能力
这些发现强调了磷脂合成能够整合对核苷酸代谢、氧化还原平衡以及膜生物物理特性的调节能力,并以此在细胞防御中发挥关键作用。
2024-08-03
Cell:从人体微生物组中挖掘全新抗菌肽,有望解决抗生素耐药性难题
该研究利用计算和实验筛选平台,挖掘了一个最近扩展的微生物组微型蛋白数据库,以寻找具有抗菌活性的候选抗菌肽,并鉴定了高效和特异的抗菌肽序列。
2024-08-21
Science:Stappenbeck团队/陆秋鹤发现降解分泌性免疫球蛋白A的全新菌种
当今肠道微生物组研究的难点在于找到真正造成某一表型或者疾病的肠道微生物,而这正是研究最关键的一步,遗憾的是目前肠道微生物组的研究大多还是关联性研究。
2024-10-09