Nature:利用新开发的 Foldseek Cluster算法一次性分析大量的蛋白结构
在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、瑞士生物信息学研究所和韩国首尔国立大学等研究机构的研究人员通过开发一种有效的方法来比较 AlphaFold 数据库中的所有预测蛋白结构,揭示了不同物种蛋白
Nature子刊:百图生科宋乐团队开发新型蛋白质结构预测工具,不依赖多序列对比,效率更高
与基于MSA的的主流蛋白质结构预测工具AlphaFold2和RoseTTAFold方法相比,HelixFold-Single在预测效率上具有很大优势,耗时要少得多,可以应用于需要大量预测的蛋白质相关任
Nature子刊:复旦大学马剑鹏团队开发智能算法,大幅提升冷冻电镜蛋白结构解析分辨率
作为蛋白质结构预测领域顶尖团队,由诺贝尔奖得主 Micheal Levitt 教授和马剑鹏教授领导的复旦大学复杂体系多尺度研究院,聚焦基础科学、交叉学科及源头底层技术,致力于推动生物大分子结构实验测定
Cell Systems封面论文:曾坚阳团队提出蛋白质口袋结构表征新方法
具体而言,对于输入的蛋白质结构,首要任务是确定其表面上anchor的位置。这些anchor位置是通过对蛋白质表面潜在结合配体的空间区域进行采样、过滤、聚类等操作后得到的。
Nat Commun:科学家揭示免疫逃逸HIV蛋白复合体的特殊结构
来自冲绳科学技术大学院大学等机构的科学家们通过研究利用冷冻电子显微镜技术揭示了APOBEC3G-Vif复合体的原子结构。
单结构域蛋白质索烃的设计和合成方面取得重要进展
以对蛋白质进行环化、索烃化、打结等拓扑改造为代表的蛋白质拓扑工程是一种重要的调控蛋白质性质的手段。近年来,基于可基因编码的蛋白质缠结基元和反应基元的“组装-反应协同”理念,发展
Nature:揭示经折叠后模拟GFP蛋白活性的DNA的三维结构
在一项新的研究中,来自美国威尔康乃尔医学院和美国国家心肺与血液研究所的研究人员发现DNA可以通过折叠成复杂的三维结构来模拟蛋白的功能。相关研究结果于2023年6月21日在线发表在Nature期刊上,论
Science:新研究揭示肌动蛋白丝两个末端的三维结构细节
肌动蛋白丝(actin filament,也称为肌动蛋纤维)-=-对从单个细胞到动物的生命运动至关重要的蛋白结构---长期以来一直被认为具有与它们的物理特征相关的极性,具有一个生长的“带刺
我国科学家基于人工智能的蛋白结构聚类分析,发现一系列新的碱基编辑器
在一项新的研究中,中国科学院遗传与发育生物学研究所的高彩霞(Gao Caixia)课题组率先使用人工智能(AI)辅助的方法,通过结构预测和分类发现具有独特功能的新型脱氨酶蛋白。这种方法为发现和构建理想
Cell:成功解析出Commander蛋白复合物的三维结构
在一项新的研究中,来自澳大利亚昆士兰大学和英国布里斯托大学的研究人员利用人工智能建立了称为Commander蛋白复合物(Commander complex)的关键细胞成分的三维图谱,以更好地了解痴呆症