单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Cell Metab | 同济大学章小清/刘玲/房玉江发现胞质pH值是胰腺β细胞中胰岛素加工和分泌的环境信号的直接联系
该研究发现Smad5在调节胰岛素加工和分泌中的作用独立于Smad4的存在。这是第一个体内证据表明Smad5在调节胰岛素生物发生中具有重要作用,与BMP信号传导无关。
2024-03-24
Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质
近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。
2024-01-29
Nat Commun | 厦门大学李剑课题组发现疟原虫抗药的新机制
该研究发现并解析了一种新的疟原虫抗药机制:UBP1位点突变→凝聚体及酶活性受损→泛素化水平升高致使MDR1从消化泡膜易位至细胞质膜→药物外排→抗药性产生。
2024-03-04
Nature子刊:伊成器课题组开发升级版不依赖CRISPR的RNA编辑技术
近同源tRNA的过表达显著提高了RESTART系统的编辑效率及无义突变修复精准度,提升了RESTART系统在疾病治疗中的应用潜力。
2024-03-08
Nature Methods | 革命性的CRISPR-CasRx筛选平台:开启癌症基因组新篇章
CasRx筛选技术在lncRNA研究中的应用,不仅为理解lncRNA的生物学功能提供了新的工具,也为癌症治疗策略的发展提供了新的思路。
2024-03-03
Cancer Cell:科学家开发出有望揭示机体免疫学特性的“脂质组蓝图”
来自哈佛医学院等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法能同时检测人类免疫系统中向T细胞展示的数千种脂质分子。
2023-09-28
Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录组学变化及FOXP1的调控作用
该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。
2024-04-11
Nat cell Biol | 浙江大学张进等团队合作报道哺乳动物生命起始时期的脂代谢重塑图景
本研究为哺乳动物着床前胚胎发育中内源性脂质组的重塑提供了宝贵的资源,并为脂质不饱和对胚胎发生和着床的调节提供了机制见解。
2024-02-04