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Science:新研究鉴定出一让有益细菌植物乳杆菌在宿主肠道中成功定植的基因

这些作者开发了一种技术,使他们能够实时观察植物乳杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)的单个细胞在果蝇肠道内的壁龛(niche)定植。

2025-01-05

Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因与空间演化

CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。

2024-11-10

大脑中的“园丁”与“杂草”Nature:利用空间转录时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应

这项研究表明,细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性,在塑造衰老过程中起着关键作用。

2024-12-27

Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子

HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。

2024-11-07

Nat Commun:揭示特殊发育信号促进基因镶嵌现象背后的分子机制

本文研究结果强调了形态因子和细胞身份在哺乳动物发育过程中促进体细胞镶嵌现象的基因组维持中的重要作用。

2024-10-07

Nature Methods:蛋白质相互作用的全新探索——高分辨率交联谱(XL-MS)标准的建立与应用前景

交联质谱(Cross-Linking Mass Spectrometry, XL-MS)因其可以提供高分辨率的结构信息,在蛋白质相互作用研究中发挥了重要作用。

2024-11-12

Ann Rheum Dis:肠道微生物变化与临床明显的类风湿关节炎发病有关

类风湿性关节炎高危人群的肠道微生物组成与众不同,包括但不限于过量的普雷沃氏菌(Prevotellaceae)。这种微生物特征是一致的,并与传统的风险因素相关。

2024-11-30

Molecular Therapy: 纳米粒靶向血脑屏障改善急性缺血性卒中

本研究使用AIS的tMCAO模型来表明靶向CAM,尤其是VCAM,与单抗和NCS结合是改善AIS治疗的一个有前途的方向。VCAM靶向的NCS和单抗在AIS脑中积累的水平比非靶向对照高1-2个数量级。

2024-03-26

北京大学最新Cell论文:白洋团队构建全球首个作物根际“细菌+病毒”基因数据库

该研究结合多种作物的根际可培养细菌基因组与宏基因组数据,构建了作物根际细菌基因组数据库(CRBC)和作物根际病毒基因组数据库(CRVC),显著扩展了公开可用的作物根际细菌基因组数量约 3 倍,鉴定的病

2025-03-15

中山大学科研人员报道代谢学AI分析新方法

DeepMSProfiler利用来自多家医院的859份肺腺癌患者、良性肺结节患者和健康人群的人血清样本进行训练和测试,在独立测试集中成功甄别了不同组别的代谢组学特征,AUC值达0.99。

2024-10-14