打开APP

Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

Nature:新研究揭示RNA控制着多样性引发逆转录因子的逆转录

RNP相互作用和主动构象Ghosh实验室发现这种RNA包裹bRT并位于桶形Avd上方,形成一种紧密的核糖核蛋白(RNP)。这种核糖核蛋白中丰富的基本相互作用精确地将RNA同源双链定位在bRT活性位点,

2025-01-29

Science:新研究揭示拟杆菌如何通过转移遗传因子击败对手

这项研究不仅揭示了肠道细菌如何通过基因转移快速进化,还为我们理解肠道微生物群落的动态提供了新的视角。

2024-10-29

Theranostics:tsRNA-1599在眼部血管生成中是促血管生成因子

本研究确定了一种新的病理性血管生成调节剂,它似乎间接影响VEGF信号传导。虽然研究者发现tsRNA-1599的作用是内皮特异性的,但tsRNA-1599也可能在非血管视网膜细胞中发挥重要作用。

2024-07-20

饶毅发表Cell子刊论文,发现迄今最重要的睡眠调控因子,开创睡眠研究新方法

该研究以对睡眠至关重要的激酶的磷酸化位点为靶点,采用生物化学和化学生物学方法,发现盐诱导激酶 3(SIK3)第 469 位苏氨酸被丙氨酸取代(T469A)的小鼠的睡眠时间增加。

2025-01-02

Immunity:细胞因子METRNL可通过破坏线粒体功能抑制CD8+T细胞抗肿瘤活性

这项工作证明细胞因子METRNL是CD8+T细胞代谢的可逆调节因子,可促进肿瘤微环境中TIL功能减退,因此,可通过靶向METRNL-E2F-PPARδ轴来支持CD8+TIL线粒体功能以发挥抗肿瘤活性。

2024-08-27

Nature子刊:将Transformer模型应用于蛋白翻译过程

Riboformer提供了解析核糖体分布变化的有力工具,展示了面向上下文的深度学习模型捕捉生物过程复杂动态的潜力。

2024-03-10

清华大学俞立团队揭示迁移体介导的细胞因子包装释放和靶向递送新机制

这项研究表明,迁移体包装释放细胞因子可能是在循环系统中建立局部细胞因子梯度的关键机制,提出了细胞因子释放和递送的新机制,为免疫应答调节提供了新见解。

2024-12-14

Cell Metabolism | 先锋因子AP-1介导衰老和成熟相关染色质重塑

这篇文章利用ATAC-seq和RNA-seq关联分析揭示了与衰老和成熟过程中的染色质重塑和TFs重分布特征,发现了先锋因子AP-1在其中的关键作用。

2024-08-04

研究揭示哺乳动物生命起始时期的脂代谢重塑

该研究描绘了小鼠和人早期胚胎脂质全景图,为探讨哺乳动物植入前胚胎发育中内源性脂质的重塑提供了资源,并为脂质不饱和度调节胚胎发育和植入提供了机制上的新见解。

2024-02-23