空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
Nature子刊:北京大学陈鹏团队开发相分离体系中蛋白质互作的时空特异性光交联技术
该研究巧妙地融合了空间特异的蛋白质标记技术与凝聚增强的代谢光交联探针,开发了一种高效且普适的时空特异光交联技术——DenseMAP。
2024-11-17
Nature多组学研究:运动从基因表达到蛋白质功能重塑我们的身体
这项研究涵盖了19种组织、25种分子平台和4个训练时间点的9,466项检测,发现了数以千计的共享和组织特异性分子改变,并在多个组织中发现了性别差异。
2024-08-14
EMBO J:揭示TRP14是细胞内半胱氨酸还原的限速酶,调节蛋白质组半胱氨酸化
长期以来,TRP14一直没有明确的功能。本项研究不仅明确了它在半胱氨酸代谢中的作用,还有助于解释它在不同物种间的进化保守性。
2024-07-08
Nature Methods | 突破蛋白质功能研究瓶颈:ORFtag高效标记与筛查技术
为了克服这些挑战,研究人员开发了一种名为ORFtag的创新技术。ORFtag是一种多功能、成本效益高且效率高的方法,能够在蛋白质组范围内进行大规模平行标记和功能研究。ORFtag使用含有启动子、选择基
2024-07-14
Cell:微胶质细胞衍生的C1q调控衰老大脑蛋白质稳态的新机制
这一系列实验结果共同证明了C1q在衰老大脑中的新功能,并突显了微胶质细胞和补体蛋白在神经元功能和认知健康中的重要性。
2024-08-23
Nature Biotechnology | 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测
质谱细胞术(Mass Cytometry)是一种通过使用金属同位素标记的抗体来标记感兴趣目标的技术,能够在单细胞水平上同时测量数百万个细胞中的大约50种蛋白质或蛋白质修饰。
2024-08-05
Nature Methods:蛋白质相互作用的全新探索——高分辨率交联质谱(XL-MS)标准的建立与应用前景
交联质谱(Cross-Linking Mass Spectrometry, XL-MS)因其可以提供高分辨率的结构信息,在蛋白质相互作用研究中发挥了重要作用。
2024-11-12