科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库
该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB(http://www.cucumberdb.com/),囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。
研究人员发布耐脱水植物基因组数据库
通常情况下极端脱水对植物是致命的,但少数陆地植物在特殊的环境中演化出营养体耐脱水(Vegetative Desiccation Tolerance,VDT)的特性。
科学家构建涵盖五大植物类群的150+物种参考代谢组及数据库
植物“参考代谢组”是指一个植物物种所有代谢物的总和。一个植物物种“参考代谢组”与代谢物之间的关系,类似于植物物种“参考基因组”与基因之间的关系。
科研人员发布人类基因组结构变异数据库和计算分析平台
复旦大学生命科学学院/人类表型组研究院教授徐书华团队、中国科学院上海营养与健康研究所研究员张国庆、复旦大学生命科学学院研究员樊少华合作,开发出人类基因组结构变异数据库PGG.SV.
Plant Biotechnology Journal:开发出叶绿体基因组综合数据库
开发了迄今为止物种数量最多的叶绿体基因组综合数据库Chloroplast Genome Information Resource(CGIR)。
版纳植物园在构建木材树种DNA条形码数据库方面获进展
木材树种是一类与人类息息相关的重要资源植物,对于维持全球生态系统服务功能和生物多样性保护具有重要价值。然而,木材非法活动经常出现在盗砍盗伐、非法加工和出口、虚假申报以规避濒危物种国际贸易公约(CITES)或避税等过程中,因此开发准确、快速的木材树种鉴定工具,对于遏制盗砍盗伐和相关非法贸易、保护生物多样性具有重要实际应用价值,而构建木材
北京大学生命学院李磊课题组发布植物microRNA数据库新版本
北京大学生命科学学院李磊研究员课题组与合作者在Nucleic Acids Research在线发表了题为“PmiREN2.0: from data annotation to functional exploration of plant microRNAs”的研究论文。该论文介绍了植物microRNA综合数据库PmiREN的最新版本。MicroRNA是真核