Cell：利用uliCUT&RUN方法在单细胞和单个胚胎中构建染色质上的蛋白结合图谱
2019年4月24日讯/生物谷BIOON/---在一项新的突破性研究中，来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN（cleavage under targets and release using nuclease）的方法进行改进，使得在使用少量细胞（包括单细胞和单个植入前胚胎）的情形下，它适合用来研究转录因子和其他的DNA结合蛋白在染色质上的占据情况。相关研
Science：在低氧条件下，染色质会快速地发生变化
2019年3月31日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自英国利物浦大学和邓迪大学的研究人员针对细胞如何应对缺氧提出了新见解。他们发现作为DNA和蛋白的复合物，染色质在低氧条件下快速地发生变化。相关研究结果发表在2019年3月15日的Science期刊上，论文标题为“Hypoxia induces rapid changes to histone methylation and rep
Nature：我国科学家揭示Snf2介导染色质重组的DNA滑动机制
2019年3月16日讯/生物谷BIOON/---染色质重塑剂包括多种具有不同生物学功能的酶，但是它们似乎具有一种相同的特征：核小体滑动活性。在这些染色质重塑酶中，Snf2作为研究这个蛋白家族作用的原型。Snf2和相关的酶具有两个保守的RecA样小叶，它们本身能够将ATP水解与染色质重塑偶联在一起。这些酶借助ATP水解沿着DNA滑动核小体的机制仍不清楚。在一项新的研究中，中国科学院物理研究所的李明（
CRISPR J：将Cas9与染色质调节肽进行融合，可提高CRISPR-Cas9编辑效率
2019年2月24日讯/生物谷BIOON/---通过Cas9核酸酶靶向感兴趣位点的CRISPR基因组编辑工具在效率上差异很大。在一项新的研究中，来自MilliporeSigma公司的研究人员报道一种新的称为CRISPR-chrom的染色质调节肽（chromatin-modulating peptide, CMP）融合策略可将CRISPR-Cas9的基因组编辑活性提高数倍。CRISPR-chrom是
人类原发性癌症染色质可接近性图谱揭示DNA-蛋白结合与癌症发生存在着关联
2018年10月27日/生物谷BIOON/---癌症是世界范围内死亡的主要原因之一。尽管2％的编码蛋白的人类基因组已被广泛研究，但是关于癌症中的非编码基因组（占人类基因组的98%）和基因调控，仍然有很多是未知的。通过转录因子（transcription factor, TF）作用于分散在非编码基因组中的发挥着长程影响的DNA调节元件，基因在适当的细胞类型和细胞状态中打开和关闭。癌症基因组图谱（Th
多篇文章解读染色质领域最新研究进展
本文中，小编整理了多篇研究报告，共同解读近年来科学家们在染色质研究领域取得的重要成果，与大家一起学习！【1】Science：重大进展！利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性doi：10.1126/science.aau0730不同细胞类型的基因组可能是相同的，但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成，而转录组指的
利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性
2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的，但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成，而转录组指的是在某一特定条件下，细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中，细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化，因此染色质可接近性有
首次构建出哺乳动物单细胞染色质可接近性图谱
2018年8月26日/生物谷BIOON/---科学家们对DNA缠绕和包装到所谓的染色质中的方式感兴趣，这是因为这会影响每个细胞中可用到的遗传信息。DNA就像串在一根绳子上的念珠。在这些分子“念珠”移动的地方会有空间形成，这样蛋白就能够访问和“读取”遗传信息。这种状态或者说这种基因组特征就是染色质可接近性（chromatin accessibility, 也译作染色质开放性）。在一项新的研究中，来自
研究揭示染色质修饰调控植物基因表达新机制
8月6日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室何跃辉研究组（与刘仁义研究组合作）和杜嘉木研究组（与美国威斯康辛大学钟雪花研究组合作）在《自然-遗传学》背靠背分别发表题为Polycomb-mediated gene silencing by the BAH-EMF1 complex in plants和EBS
两篇Nature首次重建出染色质重塑蛋白-核小体的三维结构
2018年4月27日/生物谷BIOON/---高等生物的基因组DNA被紧凑地包裹在细胞的细胞核中。DNA紧密地缠绕在大量的被称作核小体的组蛋白线轴上。比如，人细胞以这种方式容纳长约两米的DNA。然而，基因必须不断经过转录过程形成信使RNA（mRNA）来指导蛋白合成。此外，整个DNA在细胞分裂之前必须完成复制，而且DNA损伤也需要加以修复。因此，细胞必须有方法积极授予对它的基因组的访问权限。这正是染