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Nat Methods:科学家开发出一种能识别引发人类多种疾病未知因素的强大统计机器学习手段

来自匹兹堡大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法,其能通过利用统计机器学习对大量复杂的生物学数据进行分类,从而发现隐藏在疾病背后的未知因素。

2024-04-09

Nat Genet:科学家开发出能识别驱动侵袭性癌症生长的肿瘤细胞的首个计算机算法

本文研究中,研究人员通过将SPRINTER算法应用于此前产生的61,914个乳腺癌细胞和卵巢癌细胞的数据集,揭示了不同基因组变异的单细胞率的增加,以及高增殖克隆群中与增殖相关的基因扩增的富集现象。

2024-12-26

Nat Biotechnol | 揭开肿瘤亚克隆演化之谜:31种算法在模拟肿瘤中的表现评估

为了更好地理解肿瘤的演化过程,研究人员开发了许多基于高通量测序技术的亚克隆重建算法。这些算法利用肿瘤DNA测序数据中的突变特征来推断肿瘤亚克隆的组成和演化历史。

2024-06-13

科研人员开发相分离关键氨基酸鉴定算法PSPHunter

该研究报道了一种基于多信息融合的机器学习模型PSPHunter,可用于鉴定相分离蛋白和相分离关键氨基酸。

2024-04-24

Nat Biotechnol:科学家通过利用新型算法分析肿瘤的遗传组成 有望准确测定癌症的进化机制

文章中,研究人员详细了一种新型在线资源,其或能帮助科学家们选择最佳的算法进行肿瘤进化的分析,同时还能增强对肿瘤的诊断准确性和疗法计划。

2024-06-21

CRM:哈佛/斯坦福团队借助全新算法,找到调节CD8+T细胞抗癌战斗力的新通路!

GMDF算法的优势在于既可以进行跨数据库、跨瘤种的Meta分析寻找共享性特征,也可以分析特定“场景”,例如单一瘤种或根据患者性别、年龄等特征来做定制分析。

2024-07-06

空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法

该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。

2024-07-02

Nature子刊:张翼/王行环团队开发精确测定单细胞年龄的时钟算法

该研究在ClockDML上发现了与有丝分裂相关的,细胞年龄依赖的染色体可及性,是一种良好的细胞年龄标记物,开发了用该标记物来追踪单细胞年龄的计算方法EpiTrace。

2024-05-13

Nature子刊:中美三校合作,开发用于远程操控食欲的口服软体机器

这项研究展示了一种概念性的软体机器人(IngRI),用于实现胃肠道的可吞服、无线电刺激。离体和体内测试均表明,该软设备架构比现有的刚性电刺激装置具有更好的电极组织接触和更长的胃滞留时间。I

2024-08-10