大规模分析小分子/蛋白晶体结构
最近加拿大一个研究小组分析了（doi： 10.1039/c7md00381a）蛋白数据库（PDB）里的11016个蛋白/小分子配体的晶体结构（其中6444个配体有实验结合能数据），从中提取了750873个原子水平相互作用。作者发现高效率配体的疏水作用富集明显，而分子片段则以极性作用为主。最常见的七种相互作用是疏水作用、氢键、pi-叠加、弱氢键、盐桥、酰胺叠加、和正离子-pi叠加。【药源解析】：随着
最大规模的转移肿瘤基因组分析发现了啥?
肿瘤转移在晚期患者中是很难避免的一种现象，肿瘤转移同时也是导致患者死亡的一个主要原因。如何防止和减少肿瘤转移对于癌症患者的预后将有很大的帮助。要做到这一点，了解转移后的肿瘤与原发肿瘤有何区别非常重要。目前为止的大部分肿瘤基因组研究都集中在原发肿瘤上，肿瘤中新出现的基因突变也是选择靶向治疗方案的主要依据。而最近，来自美国密西根大学（University of Michigan）的科学家们
科学家首次完成对亚洲前列腺癌患者的大规模基因组测序工作
近期，由上海长海医院、深圳华大生命科学研究院（原“深圳华大基因研究院”）、芬兰奥卢大学、美国梅奥医学中心等机构组成的研究团队，首次完成了对亚洲前列腺癌患者的大规模基因组测序工作，其研究成果发表在《欧洲泌尿学》（European Urology）杂志。前列腺癌是世界范围内高发和主要的致死癌症之一。在中国，2015年约有60300个新增前列腺癌患者和26600个前列腺癌死亡患者，该数据从2
Science:科学家阐述环境微生物大规模迁徙机制
中国科学院城市环境研究所研究员朱永官领衔的国际团队系统阐述了微生物通过人与动物、污水及其他物质的流通在全球范围的迁徙及其环境与生态效应。相关研究论文发表在《科学》杂志上。数十亿年来，微生物及其所携带的基因在空气和水的自然驱动下发生迁移。此时，自然驱动力形成的对微生物的生物地理作用模式类似于它们对动物和植物的作用。近100年来，人们通过废弃物排放、旅游、全球运输等方式，将大量微生物及其基
Nat Genet：有史以来最大规模的遗传学研究 寻找骨质疏松症疗法新靶点
2017年9月6日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项刊登在国际著名杂志Nature Genetics上的研究报告中，来自昆士兰大学和麦吉尔大学的研究人员通过研究鉴别出了153个和机体骨矿物质密度流失相关的新型基因突变，骨矿物质密度的流失常常会诱发骨折。图片来源：medicalxpress.com文章中，研究者发现了一种关联性较强的名为GPC6的基因，此前研究人员并未发现该基因和骨质疏松症的
施一公：知足常乐是创新最大的敌人
9月16日晚22：38，中国科学院院士、结构生物学家、浙江西湖高等研究院院长施一公教授做客中央电视台综合频道《开讲啦》，分享了他的成长历程与人生选择，以及对人才培养、教育创新的期望与思考。科学殿堂是如此之神妙年少的施一公，牢牢记住了小学政治老师对他说的“你要为咱驻马店人争光”，他努力学习，最终成功保送到了清华大学。20岁时，父亲的意外过世给他造成了巨大的打击，也改变了他的人生态度。从此，他不再是懵
Cell：分子伴侣Hsp70让细胞的蛋白合成速度最大化
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.06.0382017年9月13日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自德国癌症研究中心、海德堡大学分子生物学中心、科隆大学和美国宾夕法尼亚州立大学的研究人员研究了一种在蛋白合成中发挥着至关重要作用的分子伴侣（molecular chaperone, 也被称作伴侣蛋白）的作用机制。他们证实蛋白合成的速度与分子伴侣
Cell：大规模RNAi筛选鉴定出对癌症重要的基因
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.07.0052017年8月5日/生物谷BIOON/---在一个新的研究中，研究人员在癌症中开展大规模的RNAi筛选，在将近400个人癌细胞系中系统性地抑制7800多个基因，从而为多种类型的癌症鉴定出潜在新的治疗靶标。这为会癌症患者治疗产生影响。相关研究结果发表在2017年7月27日的Cell期刊上，论文标题为“Project DR
Nat Methods：新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析
2017年8月3日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中，来自纽约基因组研究中心（NYGC）的研究人员通过研究开发了一种新技术，或能帮助推动单细胞RNA测序的进程，单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域，其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性，同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型，以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。图片来源：N
Cell：最大规模基因功能分析揭示出很多潜在的抗疟疾药物靶标
图片来自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.06.0302017年7月16日/生物谷BIOON/---在对疟原虫基因功能的首个有史以来大规模的研究中，来自英国韦尔科姆基金会桑格研究所等研究机构的研究人员发现疟原虫的成功归结于将它的基因组缩小到仅由必需基因组成。他们分析了这种疟原虫基因组中的一半以上的基因，结果发现三分之二的这些基因是它的存活所必不可少的。这也是迄今为止在研究