细胞器基因组组装软件开发研究取得进展
真核生物细胞器基因组包括线粒体和质体(包括叶绿体、白色体等)的全部DNA分子,是细胞质遗传的主要载体。在动植物和真菌的单个细胞内,有多个(甚至成千上万个)细胞器基因组单元的拷贝,使得利用低覆盖度的全基因组测序数据组装得到完整的细胞器基因组成为可能。随着DNA高通量测序技术的发展,测序成本下降,低覆盖度的全基因组测序数据得以大规模产生,如何快速、准确地组装细胞
基因编辑大牛揭示碱基编辑器的作用机制
2020年7月31日讯/生物谷BIOON/---在短短八年内,CRISPR-Cas9已经成为基础研究和基因治疗的首选基因组编辑器。但CRISPR-Cas9也催生了其他潜在的强大DNA操纵工具,从而可能帮助修复导致遗传性疾病的基因突变。在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校的研究人员如今获得了这些最有前途的工具之一---碱基编辑器---的首个详细的三维结
Mol Cell:中科院高彩霞课题组开发出具有高特异性和高精度的胞嘧啶碱基编辑器
2020年8月3日讯/生物谷BIOON/---碱基编辑器可以在不引起双链DNA断裂的情况下,在基因组DNA中产生高效的定向点突变,在人类疾病的基因治疗和作物植物的性状改良方面有很大前景。中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞(Gao Caixia)教授课题组一直在研发植物碱基编辑技术。他们发现胞嘧啶碱基编辑器(cytosine base editor, CB
Nat Biotechnol:新型DNA碱基编辑器扩大精准基因组编辑的应用领域
2020年7月26日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国麻省总医院和哈佛医学院的研究人员开发出的新型基因组编辑技术有潜力有助于理解基于C→G(由胞嘧啶突变为鸟嘌呤)单碱基变化的疾病相关基因突变。这些新的碱基编辑器也被设计为最大限度地减少可能导致不良副作用的非预期(“脱靶”)突变。相关研究结果于2020年7月20日在线发表在Nature Bi
Science子刊:新型碱基编辑器A3G-BE可将基因编辑准确度提高高达6000倍
2020年7月24日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自中国科学院大学、中国农业科学院和美国莱斯大学的研究人员发现一种可以大幅提升基因编辑准确性的技术。与目前被认为是最先进的碱基编辑器BE4max相比,他们推出的基因编辑工具可在疾病序列模型中将基于CRISPR的编辑准确度提高高达6000倍。相关研究结果发表在2020年7月15日的Science
开发高效的线粒体DNA碱基编辑器!
2020年7月14日讯 /生物谷BIOON /——在一项近日发表在Nature上的突破性研究(A bacterial cytidine deaminase toxin enables CRISPR-free mitochondrial base editing)中,研究人员将利剑打成犁,将一种细菌毒素转化为一种基因组编辑工具,这是第一次可以对细胞的"发电厂"
Nat Biotechnol:开发出无细胞生物传感器,可快速检测水污染物
2020年7月18日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,一种新的平台技术只需一滴水和几分钟就可以评估水的安全和质量。类似于怀孕测试,这种手持平台使用样本来提供易读的阳性或阴性结果。当检测到污染物超过美国环保署(EPA)的标准时,它就会发出绿色的光。在美国西北大学研究人员的领导下,该测试可以检测17种不同的污染物,包括铅和铜等有毒金属、药品、化妆品和
Nat Biotechnol:开发出可预测基因组编辑器脱靶活性的工具---CHANGE-seq
2020年7月19日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院、卡内基梅隆大学和美国国家标准技术局等研究机构的研究人员开发出一种易于使用的灵敏的高通量的方法,用于确定由CRISPR-Cas9等基因组编辑器引起的非预期的DNA双链断裂的位置。他们将这种方法称为CHANGE-seq(Circularization for High-