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Science:人类基因组缺失的大约1万个DNA片段可能是使我们成为人类的原因

根据美国耶鲁大学、布罗德研究所的研究人员领导的一项新研究,与其他灵长类动物的基因组相比,人类基因组缺乏的东西可能与我们进化史上增加的东西一样对人类的发育至关重要。

2023-05-06

严景华/方敏团队合作开发多抗原猴痘mRNA疫苗

包含MV和EV病毒表面糖蛋白的猴痘mRNA疫苗能够诱导出强烈的体液和细胞免疫,保护小鼠抵抗致死剂量的VACV感染。

2023-05-03

Science:揭示人类顺式调控元件和转录因子结合位点在哺乳动物中的进化景观

包括人类在内的哺乳动物实现了高度的机体复杂性,这主要是由于它们的蛋白是如何被调控的;表征人类基因组的调控景观是现代生物学的一个长期目标。当前的方法测量全基因组的生化信号,包括染色质可及性、组蛋白修饰、

2023-05-08

Science:利用经过基因改造表达肿瘤抗原的细菌作为肿瘤疫苗进行接种可产生强大的抗肿瘤免疫反应

在研究一种生活在每个人的健康皮肤上的细菌---表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)---时,来自美国斯坦福大学医学院的研究人员可能偶然发现了一种强大的抗癌新方法。

2023-04-27

Nature Genetics:王艇团队从转座子中发现泛癌症新抗原

该研究通过开发新的算法,从大数据中深入剖析了TE基因嵌合转录本在33种不同癌症类型的表达,强调了它们作为癌症靶点的可能性,并为免疫疗法及肿瘤疫苗开发提供了大量可针对的潜在靶标。

2023-04-03

同济大学刘琦团队开发基于元学习的AI模型,用于抗原-TCR亲和力识别及肿瘤新生抗原免疫原性预测

实验证明PanPep在三种应用场景Majority learning、Few-shot learning以及Zero-shot learning场景中均取得了较高的抗原-TCR预测准确率。

2023-03-20

Nature子刊:清华大学曾坚阳团队开发预测T细胞受体和抗原表位互作的AI模型

清华大学交叉信息研究院曾坚阳团队开发了TEIM模型,通过小样本学习(Few-shot learning)的思想来准确预测TCR-epitope在残基水平的相互作用和结合信息。

2023-04-10

iScience:魏平团队利用模块重组设计新型嵌合抗原受体,为新一代CAR-T提供筛选平台

该工作利用模块重组设计了一系列新型嵌合抗原受体(CAR),为肿瘤免疫治疗的改进提供了新的工具包及设计思路。

2023-04-06

《细胞》双重磅:中性粒细胞“特洛伊木马”与T细胞里应外合,联手抗癌,连无法通过抗原识别的癌细胞也不放过

这两项研究表明,肿瘤里的中性粒细胞分为促肿瘤和抗肿瘤两个阵营,其中,抗肿瘤中性粒细胞可作为T细胞的强大援军,在T细胞介导的免疫治疗中发挥必不可少的作用。

2023-04-12

Science子刊 | 上海交通大学叶菱秀等合作揭示抗体多样化过程中抗体基因DNA片段缺失和插入产生的分子机制

插入和删除(indels)是低频有害的基因组DNA改变。尽管它们很罕见,但插入是常见的,并且导致长互补决定区域3 (CDR3)的插入对于广泛中和和靶向病毒的多反应抗体的抗原结合功能至关重要。

2023-03-29