Cells & FEBES J: 干细胞与神经元相互作用在组织再生以及癌症发生中的作用
干细胞可以产生各种特定的组织，并且越来越多地用于临床应用，例如骨或软骨的置换手术等。然而，干细胞也存在于癌组织中，并参与癌症的进展和转移。此外，神经是调节干细胞的生理和再生过程的基础。然而，关于再生组织和癌症中干细胞与神经元之间相互作用的了解甚少。
科学家开发一种新方法预测蛋白质与环境间的相互作用
众所周知，蛋白质是生命的基石，在所有的生物过程中发挥着关键的作用。因此，了解它们如何与环境相互作用，对于开发有效的治疗方法和设计人工细胞的基础至关重要。近日，由瑞士联邦理工学院（EPFL）生物工程研究所蛋白质设计与免疫工程实验室(LPDI)与USI信息学院计算科学研究所、英国帝国理工学院等单位合作，开发了一种突破性的机器学习驱动技术，用于预测蛋白
研究揭示不依赖DNA相互作用的转录激活机制
12月18日，eLife 杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所张余研究组、赵国屏研究组，上海科技大学杨贝研究组和浙江大学冯钰研究组合作的题为Crl activates transcription by stabilizing active conformation of the master stress transcript
PNAS：深度学习揭示基因相互作用
近日，卡内基梅隆大学计算机科学家采用了一种深度学习方法，近年来彻底改变了人脸识别和其他基于图像的应用程序，并将其功能重定向到探索基因之间的关系。
PNAS：细菌相互作用如何使得感染恶化且难以治愈
2019年11月13日 讯 /生物谷BIOON/ --近年来，科学家发现：快速出现并产生治疗耐受性的严重感染通常是由多种微生物相互作用引起的。目前我们对这些所谓的微生物感染知之甚少，而传统的诊断方法经常将它们误认为是单独某种微生物感染。 最近，来自马里兰大学和德克萨斯大学医学分校的研究人员进行的一项新研究中，他们利用遗传分析揭示了同一类“食肉细菌”的两种不同菌株如何协同作用，从而产生更加
Nat Commun：新的数学框架帮助理解药物的相互作用
2019年11月16日 讯 /生物谷BIOON/ --两种或更多种药物(⊙o⊙)…组合可以有效治疗多种疾病，例如癌症。但是，与此同时，错误的药物组合可能会导致严重的副作用。当前，关于不同药物之间如何相互影响尚无系统性的了解。因此，阐明两种给定药物如何相互作用以及它们是否具有有益作用，将意味着朝着药物开发迈出重要的一步，以便将来更有效地治疗疾病。 在分子水平上，药物会引起人体各种细胞过程的
科学家发表非编码RNA相互作用数据库NPInter v4.0
非编码RNA对生物分子的调控作用，一直是RNA功能研究的前沿。在以往的研究中，非编码RNA被发现可以和蛋白质、RNA以及基因组相互作用，调控复杂生物过程。比如经典的长非编码RNA Xist可以和X染色体相互作用并影响剂量补偿效应。理解非编码RNA和生物分子的相互作用对于研究非编码RNA的功能以及生物分子调控网络的构建是非常重要的。10月31日，《核酸研究》（Nucleic Acids
JCIM：计算提升蛋白质-蛋白质相互作用的预测精度
蛋白质-蛋白质相互作用和识别在生物学过程中有着非常重要的作用。尽管结构生物学已经取得了较大的进展，但直接采用实验方法确定蛋白质-蛋白质复合物结构仍然非常困难。分子对接技术是预测蛋白质-蛋白质复合物结构的有效方法。蛋白质-小分子之间的相互作用一般蛋白质受体有结合口袋，相互作用区域比较明确，而蛋白质-蛋白质相互作用则有可能发生在两个蛋白质表面上任何区域。因此，蛋白质-蛋白质相互作用的预测，需要对蛋白质
活细胞中蛋白质相互作用研究取得进展
近日，中国科学院上海药物研究所陈小华课题组和中国科学院成都生物研究所唐卓课题组合作，基于开发新的非天然氨基酸，发展了一种能够在活细胞中捕捉蛋白质相互作用的新技术，该方法兼具时空可分辨和交联位点选择性的优势。研究成果“Genetically Encoded Residue-Selective Photo-Crosslinker to Capture Protein-Protein Interacti
Cell：系统性构建出病毒与人类宿主之间的蛋白-蛋白相互作用图谱
2019年9月7日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中，来自美国哥伦比亚大学的研究人员利用一种计算方法绘制出所有已知感染人类的病毒与它们感染的宿主细胞之间的蛋白-蛋白相互作用图谱。这种方法及其产生的数据已给出了大量关于病毒如何操纵它们感染的宿主细胞和引起疾病的信息。这项研究的发现包括雌激素受体在调节寨卡病毒感染中的作用和人乳头瘤病毒（HPV）如何导致癌症。相关研究结果于2019年8月29日